RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.87■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA8AA7E2F4 631 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SMC2O95347 1197 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NCAPHQ15003 741 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 CCDC125Q86Z20 511 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 IFNKQ9P0W0 207 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NID2Q14112 1375 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NTSR2O95665 410 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 AIFM3Q96NN9 605 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SETDB2Q96T68 719 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 DOCK2Q92608 1830 aa29.86■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MICU3Q86XE3 530 aa29.85■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K14Q99558 947 aa29.85■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 BIN1O00499 593 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NRDCO43847 1150 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 CUTAO60888 179 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SLC5A1P13866 664 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 RESP18Q5W5W9 173 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 WASF1Q92558 559 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K12Q12852 859 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SPATA5Q8NB90 893 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 MYO1BO43795 1136 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 GYS1P13807 737 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SHC4Q6S5L8 630 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 TMC6Q7Z403 805 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 ZNF592Q92610 1267 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 PHKBQ93100 1093 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 NAPBQ9H115 298 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 FEZ1Q99689 392 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 KRT23Q9C075 422 aa29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
OPN3-204ENST00000469376 RXRAP19793 462 aa29.82■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 SENP2Q9HC62 589 aa29.82■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 KIF18AQ8NI77 898 aa29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 CHD4Q14839 1912 aa29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 CBFA2T2O43439 604 aa29.8■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 TUBB4AP04350 444 aa29.8■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 FANCCQ00597 558 aa29.8■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 MTA3Q9BTC8 594 aa29.8■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 MBD4O95243 580 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 IFNAR1P17181 557 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 GNAT2P19087 354 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 SLC15A2Q16348 729 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 MYL5Q02045 173 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 NFIXQ14938 502 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 NYXQ9GZU5 481 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 STK32BQ9NY57 414 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 ZSWIM5Q9P217 1185 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.78■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.77■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 RASGRF1Q13972 1273 aa29.77■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.77■■■□□ 2.36
OPN3-204ENST00000469376 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 RCAN1P53805 252 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.353e-6■■■□□ 17.9
OPN3-204ENST00000469376 ERFEQ4G0M1 354 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 OLFM4Q6UX06 510 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CCP110O43303 1012 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CBX1P83916 185 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 NOSTRINQ8IVI9 506 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms