RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436329.2

GPC6-AS1-201, GPC6 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC6-AS1, Length 698 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TTC9Q92623 222 aa5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.72□□□□□ -1.49
GPC6-AS1-201ENST00000436329 A0A0A0MRY4 1105 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ALDH1L1O75891 902 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PSAPP07602 524 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ATICP31939 592 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SOX18P35713 384 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 GRIK4Q16099 956 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ARSHQ5FYA8 562 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 JAMLQ86YT9 394 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 APPBP2Q92624 585 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 E2F7Q96AV8 911 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ERP27Q96DN0 273 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 POLG2Q9UHN1 485 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.71□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 RBP3P10745 1247 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 NPR3P17342 541 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 MPSTP25325 297 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CASP2P42575 452 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TOMM20Q15388 145 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 MSL1Q68DK7 614 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 OR13H1Q8NG92 308 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EDEM1Q92611 657 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 NBPF4Q96M43 638 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ABCF2Q9UG63 623 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.7□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ESYT3A0FGR9 886 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ITGB7P26010 798 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CNGA1P29973 690 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TDO2P48775 406 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ALFQ53S48 1182 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SKAP1Q86WV1 359 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TMC1Q8TDI8 760 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SNTG2Q9NY99 539 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CNTN3Q9P232 1028 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 A6NHS1 94 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 TREHO43280 583 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 HMMRO75330 724 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SCGB1D2O95969 90 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PDGFAP04085 211 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SELPP16109 830 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EPHB1P54762 984 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 XKR5Q6UX68 686 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 HOMER1Q86YM7 354 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 PLD4Q96BZ4 506 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 ELP3Q9H9T3 547 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.68□□□□□ -1.5
GPC6-AS1-201ENST00000436329 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms