RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE3BQ13370 1112 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 FHL3Q13643 280 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL22Q6P050 247 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYMQ7RTS9 669 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMRP1Q8NCR6 262 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNERQ8NFT8 737 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP23Q9BVJ7 150 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSRNP2Q9H175 543 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC25Q9H1X3 360 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP13A1Q9HD20 1204 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF7Q9UBF6 113 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERTAD1Q9UHV2 236 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF580Q9UK33 172 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF536O15090 1300 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBBXA8MT70 800 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRF6O14896 467 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT3P25713 68 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 VIPR1P32241 457 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASPAP45381 313 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP11AP98196 1134 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR0B2Q15466 257 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RALGPS1Q5JS13 557 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLFML2BQ68BL8 750 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDZD8Q8NEN9 1154 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A3Q8WY07 619 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf44Q9H6X5 657 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-172P-201ENST00000411000 FITM1A5D6W6 292 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 AZU1P20160 251 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 HYAL1Q12794 435 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX17Q15036 470 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHACTR1Q9C0D0 580 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBLN5Q9UBX5 448 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP20Q9Y2K6 914 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP12Q9Y561 859 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNAT3A8MTJ3 354 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM229AB2RXF0 380 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRN1LQ496H8 165 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM214BQ7L5A3 538 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAPCD2Q86UD0 394 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDHDQ86WU2 507 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRG3Q86Y34 549 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARFQ8N187 725 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPEM1Q8N4L4 309 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 OXR1Q8N573 874 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRT1Q96EB6 747 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 BEGAINQ9BUH8 593 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRDM14Q9GZV8 571 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDFICQ9P1T7 246 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUSD2Q9UGT4 822 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP4E1Q9UPM8 1137 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NHS1 94 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGFBR3LH3BV60 316 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 BACH1O14867 736 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXN1O15353 648 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP20O60882 483 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMNAP02545 664 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 YBX1P67809 324 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRF1Q5T601 910 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEAQ6S8J7 498 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF627Q7L945 461 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 THAP5Q7Z6K1 395 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGI4Q8N135 537 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 FIBCD1Q8N539 461 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPACA7Q96KW9 195 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPA12BQ96MM6 686 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTPALQ9BTX7 342 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASSF4Q9H2L5 321 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIOX1Q9H6W3 641 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-172P-201ENST00000411000 INVSQ9Y283 1065 aa0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms