RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Jag1Q9QXX0 1218 aa21.9■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa21.9■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cfap58B2RW38 873 aa21.89■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Aak1Q3UHJ0 959 aa21.89■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tekt3Q6X6Z7 490 aa21.89■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stk38Q91VJ4 465 aa21.89■■□□□ 1.1
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Insm1Q63ZV0 521 aa21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Glis3Q6XP49 780 aa21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Xrcc4Q924T3 326 aa21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stk39Q9Z1W9 556 aa21.89■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cfap70D3YVL2 1141 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam186bD3Z420 943 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myl3P09542 204 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 VrtnQ3SYK4 740 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Skor1Q8BX46 964 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clic4Q9QYB1 253 aa21.88■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ifi207E9Q3L4 978 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zbtb21E9Q444 1094 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gpatch3Q8BIY1 525 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CerkQ8K4Q7 531 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Itgb4A2A863 1818 aa21.87■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 U2af2P26369 475 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lins1Q3U1D0 764 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 LrmpQ60664 539 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Peak1Q69Z38 1735 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 DaglaQ6WQJ1 1044 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vps37dQ810I0 261 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdca8Q8BHX3 289 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kdm4aQ8BW72 1064 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clip2Q9Z0H8 1047 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ltbp2O08999 1813 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ces1aE9PYP1 563 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stx8O88983 236 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scg2Q03517 617 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plekhg6Q8R0J1 787 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gimap7Q8R379 293 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubac1Q8VDI7 409 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ciapin1Q8WTY4 309 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 TnmdQ9EP64 317 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf287Q9EQB9 759 aa21.86■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Aox4Q3TYQ9 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Olfr247E9PVJ7 320 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Olfr819K7N727 320 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp53P15975 1069 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tmem109Q3UBX0 243 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tm4sf1Q64302 202 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mxd3Q80US8 206 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prkag3Q8BGM7 489 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdk8Q8R3L8 464 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa21.85■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vmn2r68L7N2B3 851 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam178bQ24JP3 464 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp51Q3U4L8 781 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GnptabQ69ZN6 1235 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Triml1Q8BVP1 470 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kcnj14Q8JZN3 434 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rgs17Q9QZB0 210 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ecm29Q6PDI5 1840 aa21.84■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam184aE9PW83 1143 aa21.83■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 EgfrQ01279 1210 aa21.83■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc27a1Q60714 646 aa21.83■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa21.83■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psme4Q5SSW2 1843 aa21.83■■□□□ 1.09
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Csf1rP09581 977 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Il7P10168 154 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptpn12P35831 775 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eya3P97480 510 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 1700013D24RikQ0P521 120 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp50Q6P8X6 390 aa21.83■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zmym2Q9CU65 1376 aa21.82■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 A0A1Y7VML8 143 aa21.82■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Epha2Q03145 977 aa21.82■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa21.82■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccp110Q7TSH4 1004 aa21.82■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mctp1E9PV86 951 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ampd3O08739 766 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AaasP58742 546 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CrkQ64010 304 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Txnrd3Q99MD6 652 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tulp1Q9Z273 543 aa21.81■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp3a25O09158 503 aa21.8■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eef2P58252 858 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k12Q60700 888 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms