RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598125.5

TIMM50-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-211ENST00000598125 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TIMM50-211ENST00000598125 A6NED7 52 aa6.86□□□□□ -1.31
TIMM50-211ENST00000598125 MT1GP13640 62 aa6.82□□□□□ -1.32
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.79□□□□□ -1.32
TIMM50-211ENST00000598125 MT1LQ93083 61 aa6.79□□□□□ -1.32
TIMM50-211ENST00000598125 PP632Q6XCG6 107 aa6.78□□□□□ -1.32
TIMM50-211ENST00000598125 MT1MQ8N339 61 aa6.71□□□□□ -1.34
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP12-3P60328 96 aa6.7□□□□□ -1.34
TIMM50-211ENST00000598125 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.6□□□□□ -1.35
TIMM50-211ENST00000598125 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.55□□□□□ -1.36
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMM50-211ENST00000598125 ROMO1P60602 79 aa6.5□□□□□ -1.37
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.38□□□□□ -1.39
TIMM50-211ENST00000598125 LCE4AQ5TA78 99 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMM50-211ENST00000598125 LCE1DQ5T752 114 aa6.28□□□□□ -1.4
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.27□□□□□ -1.41
TIMM50-211ENST00000598125 MT4P47944 62 aa6.23□□□□□ -1.41
TIMM50-211ENST00000598125 BRK1Q8WUW1 75 aa6.23□□□□□ -1.41
TIMM50-211ENST00000598125 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.19□□□□□ -1.42
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TIMM50-211ENST00000598125 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.09□□□□□ -1.43
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMM50-211ENST00000598125 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP12-4P60329 112 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMM50-211ENST00000598125 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMM50-211ENST00000598125 PMAIP1Q13794 54 aa5.85□□□□□ -1.47
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.82□□□□□ -1.48
TIMM50-211ENST00000598125 MT1AP04731 61 aa5.78□□□□□ -1.48
TIMM50-211ENST00000598125 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TIMM50-211ENST00000598125 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.77□□□□□ -1.49
TIMM50-211ENST00000598125 PRO0628Q9UI54 55 aa5.75□□□□□ -1.49
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.73□□□□□ -1.49
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.72□□□□□ -1.49
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.72□□□□□ -1.49
TIMM50-211ENST00000598125 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.7□□□□□ -1.5
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.55□□□□□ -1.52
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.54□□□□□ -1.52
TIMM50-211ENST00000598125 PRAC1Q96KF2 57 aa5.51□□□□□ -1.53
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.47□□□□□ -1.53
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.42□□□□□ -1.54
TIMM50-211ENST00000598125 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.42□□□□□ -1.54
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMM50-211ENST00000598125 SVIPQ8NHG7 77 aa5.29□□□□□ -1.56
TIMM50-211ENST00000598125 MT3P25713 68 aa5.28□□□□□ -1.56
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-8O75690 187 aa5.15□□□□□ -1.59
TIMM50-211ENST00000598125 OBSCNQ5VST9 7968 aa5□□□□□ -1.61
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.91□□□□□ -1.62
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.84□□□□□ -1.63
TIMM50-211ENST00000598125 LCE1EQ5T753 118 aa4.79□□□□□ -1.64
TIMM50-211ENST00000598125 LUZP6Q538Z0 58 aa4.69□□□□□ -1.66
TIMM50-211ENST00000598125 MUC5ACP98088 5654 aa4.66□□□□□ -1.66
TIMM50-211ENST00000598125 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TIMM50-211ENST00000598125 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TIMM50-211ENST00000598125 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMM50-211ENST00000598125 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.48□□□□□ -1.69
TIMM50-211ENST00000598125 LCE1CQ5T751 118 aa4.45□□□□□ -1.7
TIMM50-211ENST00000598125 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.27□□□□□ -1.73
TIMM50-211ENST00000598125 NDUFAF8A1L188 74 aa4.14□□□□□ -1.75
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.97□□□□□ -1.77
TIMM50-211ENST00000598125 LCE1FQ5T754 118 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.77□□□□□ -1.81
TIMM50-211ENST00000598125 A0A0A0MQY5 61 aa3.58□□□□□ -1.84
TIMM50-211ENST00000598125 PHGR1C9JFL3 82 aa3.45□□□□□ -1.86
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.4□□□□□ -1.87
TIMM50-211ENST00000598125 INE1O15225 51 aa3.38□□□□□ -1.87
TIMM50-211ENST00000598125 PRM1P04553 51 aa3.33□□□□□ -1.88
TIMM50-211ENST00000598125 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.07□□□□□ -1.92
TIMM50-211ENST00000598125 H3BS24 57 aa2.82□□□□□ -1.96
TIMM50-211ENST00000598125 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.52□□□□□ -2.01
TIMM50-211ENST00000598125 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.4 ms