RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.29	□□□□□ -1.72
USP36-223	ENST00000592326	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.26	□□□□□ -1.73
USP36-223	ENST00000592326	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.25	□□□□□ -1.73
USP36-223	ENST00000592326	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
USP36-223	ENST00000592326	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.23	□□□□□ -1.73
USP36-223	ENST00000592326	TNP1	P09430	55 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP36-223	ENST00000592326	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP36-223	ENST00000592326	MT1E	P04732	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP36-223	ENST00000592326	ROMO1	P60602	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	MT4	P47944	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	MT1G	P13640	62 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.09	□□□□□ -1.75
USP36-223	ENST00000592326	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP36-223	ENST00000592326	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP36-223	ENST00000592326	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP36-223	ENST00000592326	MT1M	Q8N339	61 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP36-223	ENST00000592326	MT1L	Q93083	61 aa		3.98	□□□□□ -1.77
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.96	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.94	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.93	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.92	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP36-223	ENST00000592326	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.81	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.8	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.78	□□□□□ -1.8
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.75	□□□□□ -1.81
USP36-223	ENST00000592326	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.71	□□□□□ -1.82
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
USP36-223	ENST00000592326	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.64	□□□□□ -1.83
USP36-223	ENST00000592326	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.63	□□□□□ -1.83
USP36-223	ENST00000592326	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.62	□□□□□ -1.83
USP36-223	ENST00000592326	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.49	□□□□□ -1.85
USP36-223	ENST00000592326	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.46	□□□□□ -1.86
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.43	□□□□□ -1.86
USP36-223	ENST00000592326	MT1A	P04731	61 aa		3.39	□□□□□ -1.87
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.39	□□□□□ -1.87
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.32	□□□□□ -1.88
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.29	□□□□□ -1.88
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.28	□□□□□ -1.88
USP36-223	ENST00000592326	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.22	□□□□□ -1.89
USP36-223	ENST00000592326	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
USP36-223	ENST00000592326	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP36-223	ENST00000592326	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
USP36-223	ENST00000592326	MT3	P25713	68 aa		3.14	□□□□□ -1.91
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP36-223	ENST00000592326	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.89	□□□□□ -1.95
USP36-223	ENST00000592326	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.82	□□□□□ -1.96
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.76	□□□□□ -1.97
USP36-223	ENST00000592326	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
USP36-223	ENST00000592326	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.7	□□□□□ -1.98
USP36-223	ENST00000592326	INE1	O15225	51 aa		2.69	□□□□□ -1.98
USP36-223	ENST00000592326	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP36-223	ENST00000592326	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.43	□□□□□ -2.02
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
USP36-223	ENST00000592326	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.35	□□□□□ -2.03
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.21	□□□□□ -2.06
USP36-223	ENST00000592326	PRM1	P04553	51 aa		2.14	□□□□□ -2.07
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.12	□□□□□ -2.07
USP36-223	ENST00000592326	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.96	□□□□□ -2.1
USP36-223	ENST00000592326	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.77	□□□□□ -2.13
USP36-223	ENST00000592326	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.39	□□□□□ -2.19

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 261.5 ms