RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.44□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 K7ERS5 55 aa4.43□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP10-12P60413 245 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.42□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP10-5P60370 271 aa4.41□□□□□ -1.7
SEH1L-209ENST00000592170 MT1XP80297 61 aa4.38□□□□□ -1.71
SEH1L-209ENST00000592170 PRAC1Q96KF2 57 aa4.37□□□□□ -1.71
SEH1L-209ENST00000592170 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFAF8A1L188 74 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-209ENST00000592170 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-209ENST00000592170 PRO0628Q9UI54 55 aa4.27□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 MDN1Q9NU22 5596 aa4.26□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.22□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 ROMO1P60602 79 aa4.22□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.22□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 KMT2DO14686 5537 aa4.21□□□□□ -1.73
SEH1L-209ENST00000592170 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.21□□□□□ -1.74
SEH1L-209ENST00000592170 PMAIP1Q13794 54 aa4.2□□□□□ -1.74
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-9P26371 169 aa4.19□□□□□ -1.74
SEH1L-209ENST00000592170 TNP1P09430 55 aa4.18□□□□□ -1.74
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.16□□□□□ -1.74
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.15□□□□□ -1.75
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2EP22531 72 aa4.09□□□□□ -1.75
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2BP35325 72 aa4.09□□□□□ -1.75
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2AP35326 72 aa4.09□□□□□ -1.75
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.07□□□□□ -1.76
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-209ENST00000592170 LCE3AQ5TA76 89 aa4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-209ENST00000592170 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR2DP22532 72 aa3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-209ENST00000592170 PP632Q6XCG6 107 aa3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-209ENST00000592170 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.93□□□□□ -1.78
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.92□□□□□ -1.78
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.91□□□□□ -1.78
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.89□□□□□ -1.79
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP12-3P60328 96 aa3.88□□□□□ -1.79
SEH1L-209ENST00000592170 MT1EP04732 61 aa3.85□□□□□ -1.79
SEH1L-209ENST00000592170 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.84□□□□□ -1.79
SEH1L-209ENST00000592170 MT1LQ93083 61 aa3.75□□□□□ -1.81
SEH1L-209ENST00000592170 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.73□□□□□ -1.81
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.71□□□□□ -1.82
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.7□□□□□ -1.82
SEH1L-209ENST00000592170 MT1GP13640 62 aa3.67□□□□□ -1.82
SEH1L-209ENST00000592170 MT1MQ8N339 61 aa3.64□□□□□ -1.83
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.56□□□□□ -1.84
SEH1L-209ENST00000592170 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.52□□□□□ -1.85
SEH1L-209ENST00000592170 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.49□□□□□ -1.85
SEH1L-209ENST00000592170 MT4P47944 62 aa3.49□□□□□ -1.85
SEH1L-209ENST00000592170 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.45□□□□□ -1.86
SEH1L-209ENST00000592170 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.43□□□□□ -1.86
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.43□□□□□ -1.86
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.35□□□□□ -1.87
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SEH1L-209ENST00000592170 LUZP6Q538Z0 58 aa3.24□□□□□ -1.89
SEH1L-209ENST00000592170 MT1AP04731 61 aa3.19□□□□□ -1.9
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.16□□□□□ -1.9
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.14□□□□□ -1.91
SEH1L-209ENST00000592170 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.12□□□□□ -1.91
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP12-4P60329 112 aa3.09□□□□□ -1.91
SEH1L-209ENST00000592170 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SEH1L-209ENST00000592170 LCE1CQ5T751 118 aa3.06□□□□□ -1.92
SEH1L-209ENST00000592170 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.06□□□□□ -1.92
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.02□□□□□ -1.93
SEH1L-209ENST00000592170 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SEH1L-209ENST00000592170 MUC5ACP98088 5654 aa2.95□□□□□ -1.94
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.93□□□□□ -1.94
SEH1L-209ENST00000592170 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-8O75690 187 aa2.87□□□□□ -1.95
SEH1L-209ENST00000592170 INE1O15225 51 aa2.54□□□□□ -2
SEH1L-209ENST00000592170 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.46□□□□□ -2.02
SEH1L-209ENST00000592170 PRM1P04553 51 aa2.2□□□□□ -2.06
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.19□□□□□ -2.06
SEH1L-209ENST00000592170 PHGR1C9JFL3 82 aa2.06□□□□□ -2.08
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.57□□□□□ -2.16
SEH1L-209ENST00000592170 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.19□□□□□ -2.22
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