RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.57□□□□□ -1.68
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.56□□□□□ -1.68
CTIF-208ENST00000590422 MT1EP04732 61 aa4.54□□□□□ -1.68
CTIF-208ENST00000590422 K7ERS5 55 aa4.53□□□□□ -1.68
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.52□□□□□ -1.69
CTIF-208ENST00000590422 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.46□□□□□ -1.7
CTIF-208ENST00000590422 BRK1Q8WUW1 75 aa4.44□□□□□ -1.7
CTIF-208ENST00000590422 LCE1DQ5T752 114 aa4.43□□□□□ -1.7
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.41□□□□□ -1.7
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.4□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.39□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 PRO0628Q9UI54 55 aa4.37□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 MT1GP13640 62 aa4.36□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 TNP1P09430 55 aa4.35□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 MT4P47944 62 aa4.35□□□□□ -1.71
CTIF-208ENST00000590422 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.34□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 MT1MQ8N339 61 aa4.33□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 ROMO1P60602 79 aa4.32□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 LCE4AQ5TA78 99 aa4.32□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 PP632Q6XCG6 107 aa4.31□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.3□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 MT1LQ93083 61 aa4.3□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.28□□□□□ -1.72
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.25□□□□□ -1.73
CTIF-208ENST00000590422 LCE3AQ5TA76 89 aa4.22□□□□□ -1.73
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.22□□□□□ -1.73
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.22□□□□□ -1.73
CTIF-208ENST00000590422 PMAIP1Q13794 54 aa4.21□□□□□ -1.74
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.12□□□□□ -1.75
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.07□□□□□ -1.76
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.07□□□□□ -1.76
CTIF-208ENST00000590422 PRAC1Q96KF2 57 aa4.07□□□□□ -1.76
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP12-3P60328 96 aa4.06□□□□□ -1.76
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.02□□□□□ -1.77
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CTIF-208ENST00000590422 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.95□□□□□ -1.78
CTIF-208ENST00000590422 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.94□□□□□ -1.78
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
CTIF-208ENST00000590422 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.91□□□□□ -1.78
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP12-4P60329 112 aa3.89□□□□□ -1.79
CTIF-208ENST00000590422 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.85□□□□□ -1.79
CTIF-208ENST00000590422 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.78□□□□□ -1.8
CTIF-208ENST00000590422 LUZP6Q538Z0 58 aa3.72□□□□□ -1.81
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.72□□□□□ -1.81
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.69□□□□□ -1.82
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.66□□□□□ -1.82
CTIF-208ENST00000590422 MT1AP04731 61 aa3.64□□□□□ -1.83
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-8O75690 187 aa3.61□□□□□ -1.83
CTIF-208ENST00000590422 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CTIF-208ENST00000590422 MUC5ACP98088 5654 aa3.6□□□□□ -1.83
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.58□□□□□ -1.84
CTIF-208ENST00000590422 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.57□□□□□ -1.84
CTIF-208ENST00000590422 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.53□□□□□ -1.84
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.53□□□□□ -1.84
CTIF-208ENST00000590422 NDUFAF8A1L188 74 aa3.51□□□□□ -1.85
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.42□□□□□ -1.86
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.35□□□□□ -1.87
CTIF-208ENST00000590422 MT3P25713 68 aa3.31□□□□□ -1.88
CTIF-208ENST00000590422 LCE1EQ5T753 118 aa3.09□□□□□ -1.91
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3□□□□□ -1.93
CTIF-208ENST00000590422 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.96□□□□□ -1.94
CTIF-208ENST00000590422 LCE1CQ5T751 118 aa2.88□□□□□ -1.95
CTIF-208ENST00000590422 INE1O15225 51 aa2.82□□□□□ -1.96
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.79□□□□□ -1.96
CTIF-208ENST00000590422 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.79□□□□□ -1.96
CTIF-208ENST00000590422 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.69□□□□□ -1.98
CTIF-208ENST00000590422 LCE1FQ5T754 118 aa2.65□□□□□ -1.99
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.64□□□□□ -1.99
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
CTIF-208ENST00000590422 PHGR1C9JFL3 82 aa2.45□□□□□ -2.02
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.41□□□□□ -2.02
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.26□□□□□ -2.05
CTIF-208ENST00000590422 PRM1P04553 51 aa2.23□□□□□ -2.05
CTIF-208ENST00000590422 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.2□□□□□ -2.06
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.85□□□□□ -2.11
CTIF-208ENST00000590422 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
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