RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC01554Q52M75 96 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.8□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRR2EP22531 72 aa2.79□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRR2BP35325 72 aa2.79□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRR2AP35326 72 aa2.79□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 K7ERS5 55 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1B0GU33 70 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP10-12P60413 245 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 A6NED7 52 aa2.74□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.74□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.74□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.74□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 BRK1Q8WUW1 75 aa2.73□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1B0GU69 56 aa2.72□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP12-1P59990 96 aa2.72□□□□□ -1.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRR2DP22532 72 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR15LQ9BU68 103 aa2.66□□□□□ -1.98
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0D9SG42 100 aa2.65□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 A8MU10 97 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 Q1T7F1 81 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 MT3P25713 68 aa2.63□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 UQCR11O14957 56 aa2.61□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.6□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.6□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.59□□□□□ -1.99
EFTUD2-210ENST00000588340 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1EP04732 61 aa2.55□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.54□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 ROMO1P60602 79 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP5-8O75690 187 aa2.51□□□□□ -2.01
EFTUD2-210ENST00000588340 TNP1P09430 55 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE3AQ5TA76 89 aa2.48□□□□□ -2.01
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1GP13640 62 aa2.47□□□□□ -2.01
EFTUD2-210ENST00000588340 PP632Q6XCG6 107 aa2.45□□□□□ -2.02
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1LQ93083 61 aa2.45□□□□□ -2.02
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1MQ8N339 61 aa2.43□□□□□ -2.02
EFTUD2-210ENST00000588340 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.43□□□□□ -2.02
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP12-3P60328 96 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.38□□□□□ -2.03
EFTUD2-210ENST00000588340 MT4P47944 62 aa2.36□□□□□ -2.03
EFTUD2-210ENST00000588340 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.34□□□□□ -2.04
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE1FQ5T754 118 aa2.28□□□□□ -2.04
EFTUD2-210ENST00000588340 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.24□□□□□ -2.05
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.22□□□□□ -2.05
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.2□□□□□ -2.06
EFTUD2-210ENST00000588340 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.19□□□□□ -2.06
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP12-4P60329 112 aa2.18□□□□□ -2.06
EFTUD2-210ENST00000588340 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.06
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.15□□□□□ -2.07
EFTUD2-210ENST00000588340 INE1O15225 51 aa2.09□□□□□ -2.07
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1AP04731 61 aa2.09□□□□□ -2.07
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.06□□□□□ -2.08
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.97□□□□□ -2.09
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.92□□□□□ -2.1
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC5ACP98088 5654 aa1.87□□□□□ -2.11
EFTUD2-210ENST00000588340 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE1CQ5T751 118 aa1.82□□□□□ -2.12
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.82□□□□□ -2.12
EFTUD2-210ENST00000588340 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.72□□□□□ -2.13
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.69□□□□□ -2.14
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.39□□□□□ -2.19
EFTUD2-210ENST00000588340 PHGR1C9JFL3 82 aa1.3□□□□□ -2.2
EFTUD2-210ENST00000588340 PRM1P04553 51 aa1.19□□□□□ -2.22
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.99□□□□□ -2.25
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.84□□□□□ -2.28
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.3 ms