RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.05□□□□□ -1.76
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.03□□□□□ -1.76
CTIF-204ENST00000587769 MT1EP04732 61 aa4.01□□□□□ -1.77
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.99□□□□□ -1.77
CTIF-204ENST00000587769 LCE3BQ5TA77 95 aa3.98□□□□□ -1.77
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP12-3P60328 96 aa3.94□□□□□ -1.78
CTIF-204ENST00000587769 PP632Q6XCG6 107 aa3.94□□□□□ -1.78
CTIF-204ENST00000587769 PRO0628Q9UI54 55 aa3.94□□□□□ -1.78
CTIF-204ENST00000587769 PMAIP1Q13794 54 aa3.93□□□□□ -1.78
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.91□□□□□ -1.78
CTIF-204ENST00000587769 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.88□□□□□ -1.79
CTIF-204ENST00000587769 MT1LQ93083 61 aa3.88□□□□□ -1.79
CTIF-204ENST00000587769 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CTIF-204ENST00000587769 MT1GP13640 62 aa3.83□□□□□ -1.8
CTIF-204ENST00000587769 SVIPQ8NHG7 77 aa3.81□□□□□ -1.8
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CTIF-204ENST00000587769 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.73□□□□□ -1.81
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CTIF-204ENST00000587769 LCE1DQ5T752 114 aa3.62□□□□□ -1.83
CTIF-204ENST00000587769 LCE4AQ5TA78 99 aa3.61□□□□□ -1.83
CTIF-204ENST00000587769 MT4P47944 62 aa3.58□□□□□ -1.84
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CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.55□□□□□ -1.84
CTIF-204ENST00000587769 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.51□□□□□ -1.85
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CTIF-204ENST00000587769 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.35□□□□□ -1.87
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CTIF-204ENST00000587769 KRTAP12-4P60329 112 aa3.31□□□□□ -1.88
CTIF-204ENST00000587769 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.3□□□□□ -1.88
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CTIF-204ENST00000587769 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.26□□□□□ -1.89
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.25□□□□□ -1.89
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.23□□□□□ -1.89
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.23□□□□□ -1.89
CTIF-204ENST00000587769 H3BS24 57 aa3.14□□□□□ -1.91
CTIF-204ENST00000587769 LUZP6Q538Z0 58 aa3.11□□□□□ -1.91
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.11□□□□□ -1.91
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.07□□□□□ -1.92
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CTIF-204ENST00000587769 MT3P25713 68 aa3.01□□□□□ -1.93
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-8O75690 187 aa2.97□□□□□ -1.93
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CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.79□□□□□ -1.96
CTIF-204ENST00000587769 MUC5ACP98088 5654 aa2.78□□□□□ -1.96
CTIF-204ENST00000587769 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.69□□□□□ -1.98
CTIF-204ENST00000587769 LCE1EQ5T753 118 aa2.67□□□□□ -1.98
CTIF-204ENST00000587769 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.59□□□□□ -1.99
CTIF-204ENST00000587769 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.51□□□□□ -2.01
CTIF-204ENST00000587769 LCE1CQ5T751 118 aa2.49□□□□□ -2.01
CTIF-204ENST00000587769 INE1O15225 51 aa2.31□□□□□ -2.04
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.24□□□□□ -2.05
CTIF-204ENST00000587769 LCE1FQ5T754 118 aa2.18□□□□□ -2.06
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.14□□□□□ -2.07
CTIF-204ENST00000587769 PRM1P04553 51 aa2.13□□□□□ -2.07
CTIF-204ENST00000587769 PHGR1C9JFL3 82 aa1.96□□□□□ -2.1
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.92□□□□□ -2.1
CTIF-204ENST00000587769 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.82□□□□□ -2.12
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.48□□□□□ -2.17
CTIF-204ENST00000587769 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.35□□□□□ -2.19
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