RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583399.5

CNDP2-222, Transcript of carnosine dipeptidase 2, human

TSL 2

Gene CNDP2, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNDP2-222	ENST00000583399	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CNDP2-222	ENST00000583399	SPRR2D	P22532	72 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CNDP2-222	ENST00000583399	TNP1	P09430	55 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CNDP2-222	ENST00000583399	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CNDP2-222	ENST00000583399	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CNDP2-222	ENST00000583399	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNDP2-222	ENST00000583399	MT1E	P04732	61 aa		5	□□□□□ -1.61
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNDP2-222	ENST00000583399	MT1G	P13640	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNDP2-222	ENST00000583399	MT1L	Q93083	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNDP2-222	ENST00000583399	MT1M	Q8N339	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNDP2-222	ENST00000583399	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	MT4	P47944	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CNDP2-222	ENST00000583399	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CNDP2-222	ENST00000583399	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CNDP2-222	ENST00000583399	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CNDP2-222	ENST00000583399	MT1A	P04731	61 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CNDP2-222	ENST00000583399	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4	□□□□□ -1.77
CNDP2-222	ENST00000583399	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CNDP2-222	ENST00000583399	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CNDP2-222	ENST00000583399	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CNDP2-222	ENST00000583399	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CNDP2-222	ENST00000583399		A0A0A0MQY5	61 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CNDP2-222	ENST00000583399	MT3	P25713	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CNDP2-222	ENST00000583399		H3BS24	57 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CNDP2-222	ENST00000583399	INE1	O15225	51 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.93	□□□□□ -1.94
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
CNDP2-222	ENST00000583399	PRM1	P04553	51 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CNDP2-222	ENST00000583399	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CNDP2-222	ENST00000583399	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CNDP2-222	ENST00000583399	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.35	□□□□□ -2.03
CNDP2-222	ENST00000583399	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.06	□□□□□ -2.08
CNDP2-222	ENST00000583399	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.57	□□□□□ -2.16

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