RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa12□□□□□ -0.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROMO1P60602 79 aa11.97□□□□□ -0.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE5AQ5TCM9 118 aa11.97□□□□□ -0.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP12-3P60328 96 aa11.87□□□□□ -0.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP23-1A1A580 65 aa11.86□□□□□ -0.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT1GP13640 62 aa11.83□□□□□ -0.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT1LQ93083 61 aa11.83□□□□□ -0.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRK1Q8WUW1 75 aa11.76□□□□□ -0.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 PP632Q6XCG6 107 aa11.74□□□□□ -0.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE3BQ5TA77 95 aa11.73□□□□□ -0.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT1MQ8N339 61 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa11.33□□□□□ -0.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa11.3□□□□□ -0.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa11.28□□□□□ -0.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa11.26□□□□□ -0.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMAIP1Q13794 54 aa11.09□□□□□ -0.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE3CQ5T5A8 94 aa10.99□□□□□ -0.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRO0628Q9UI54 55 aa10.84□□□□□ -0.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE4AQ5TA78 99 aa10.76□□□□□ -0.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa10.7□□□□□ -0.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa10.69□□□□□ -0.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC100996750A0A140TA64 210 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE1DQ5T752 114 aa10.57□□□□□ -0.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT4P47944 62 aa10.53□□□□□ -0.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAC1Q96KF2 57 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMCN1Q96RW7 5635 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP12-4P60329 112 aa10.17□□□□□ -0.78
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa10.07□□□□□ -0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT1AP04731 61 aa10.07□□□□□ -0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa10.04□□□□□ -0.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa9.72□□□□□ -0.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR98Q8WXG9 6306 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa9.59□□□□□ -0.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-2Q701N4 177 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa9.46□□□□□ -0.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa9.39□□□□□ -0.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT3P25713 68 aa9.2□□□□□ -0.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa9□□□□□ -0.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa9□□□□□ -0.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BS24 57 aa8.93□□□□□ -0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 OBSCNQ5VST9 7968 aa8.81□□□□□ -1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LUZP6Q538Z0 58 aa8.81□□□□□ -1
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-8O75690 187 aa8.68□□□□□ -1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A0MQY5 61 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE1EQ5T753 118 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.11□□□□□ -1.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE3DQ9BYE3 92 aa8.07□□□□□ -1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC5ACP98088 5654 aa8.06□□□□□ -1.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.75□□□□□ -1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE1BQ5T7P3 118 aa7.73□□□□□ -1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.71□□□□□ -1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE1CQ5T751 118 aa7.7□□□□□ -1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF8A1L188 74 aa7.68□□□□□ -1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.91□□□□□ -1.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCE1FQ5T754 118 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 INE1O15225 51 aa6.3□□□□□ -1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRM1P04553 51 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHGR1C9JFL3 82 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.88□□□□□ -1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.33□□□□□ -1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.15□□□□□ -1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms