RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 PRO0628Q9UI54 55 aa5.64□□□□□ -1.51
CHTF18-217ENST00000567620 PMAIP1Q13794 54 aa5.57□□□□□ -1.52
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.57□□□□□ -1.52
CHTF18-217ENST00000567620 MT1EP04732 61 aa5.54□□□□□ -1.52
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.51□□□□□ -1.53
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.5□□□□□ -1.53
CHTF18-217ENST00000567620 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.49□□□□□ -1.53
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.48□□□□□ -1.53
CHTF18-217ENST00000567620 LCE3AQ5TA76 89 aa5.46□□□□□ -1.54
CHTF18-217ENST00000567620 PP632Q6XCG6 107 aa5.4□□□□□ -1.54
CHTF18-217ENST00000567620 MT1GP13640 62 aa5.39□□□□□ -1.55
CHTF18-217ENST00000567620 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CHTF18-217ENST00000567620 MT1LQ93083 61 aa5.31□□□□□ -1.56
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP12-3P60328 96 aa5.28□□□□□ -1.56
CHTF18-217ENST00000567620 MT1MQ8N339 61 aa5.28□□□□□ -1.56
CHTF18-217ENST00000567620 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.26□□□□□ -1.57
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.25□□□□□ -1.57
CHTF18-217ENST00000567620 PRAC1Q96KF2 57 aa5.21□□□□□ -1.58
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.18□□□□□ -1.58
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.11□□□□□ -1.59
CHTF18-217ENST00000567620 MT4P47944 62 aa5.1□□□□□ -1.59
CHTF18-217ENST00000567620 LCE4AQ5TA78 99 aa5.1□□□□□ -1.59
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1DQ5T752 114 aa5.09□□□□□ -1.59
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.08□□□□□ -1.6
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.07□□□□□ -1.6
CHTF18-217ENST00000567620 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.04□□□□□ -1.6
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.96□□□□□ -1.62
CHTF18-217ENST00000567620 SVIPQ8NHG7 77 aa4.95□□□□□ -1.62
CHTF18-217ENST00000567620 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.91□□□□□ -1.62
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.91□□□□□ -1.62
CHTF18-217ENST00000567620 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.89□□□□□ -1.63
CHTF18-217ENST00000567620 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.81□□□□□ -1.64
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP12-4P60329 112 aa4.76□□□□□ -1.65
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.72□□□□□ -1.65
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.7□□□□□ -1.66
CHTF18-217ENST00000567620 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.69□□□□□ -1.66
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.66□□□□□ -1.66
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.6□□□□□ -1.67
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.59□□□□□ -1.67
CHTF18-217ENST00000567620 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CHTF18-217ENST00000567620 MT1AP04731 61 aa4.52□□□□□ -1.69
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.5□□□□□ -1.69
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.48□□□□□ -1.69
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.38□□□□□ -1.71
CHTF18-217ENST00000567620 LUZP6Q538Z0 58 aa4.36□□□□□ -1.71
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.34□□□□□ -1.71
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.31□□□□□ -1.72
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.31□□□□□ -1.72
CHTF18-217ENST00000567620 MT3P25713 68 aa4.17□□□□□ -1.74
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-8O75690 187 aa4.13□□□□□ -1.75
CHTF18-217ENST00000567620 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.06□□□□□ -1.76
CHTF18-217ENST00000567620 NDUFAF8A1L188 74 aa4□□□□□ -1.77
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.99□□□□□ -1.77
CHTF18-217ENST00000567620 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.9□□□□□ -1.79
CHTF18-217ENST00000567620 MUC5ACP98088 5654 aa3.87□□□□□ -1.79
CHTF18-217ENST00000567620 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1EQ5T753 118 aa3.77□□□□□ -1.81
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.64□□□□□ -1.83
CHTF18-217ENST00000567620 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.64□□□□□ -1.83
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.54□□□□□ -1.84
CHTF18-217ENST00000567620 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.52□□□□□ -1.85
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1CQ5T751 118 aa3.5□□□□□ -1.85
CHTF18-217ENST00000567620 A0A0A0MQY5 61 aa3.49□□□□□ -1.85
CHTF18-217ENST00000567620 INE1O15225 51 aa3.36□□□□□ -1.87
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.28□□□□□ -1.88
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.14□□□□□ -1.91
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1FQ5T754 118 aa3.06□□□□□ -1.92
CHTF18-217ENST00000567620 H3BS24 57 aa2.99□□□□□ -1.93
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
CHTF18-217ENST00000567620 PRM1P04553 51 aa2.92□□□□□ -1.94
CHTF18-217ENST00000567620 PHGR1C9JFL3 82 aa2.77□□□□□ -1.97
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.76□□□□□ -1.97
CHTF18-217ENST00000567620 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.09□□□□□ -2.07
CHTF18-217ENST00000567620 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.8□□□□□ -2.12
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