RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.69	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.69	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.69	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.68	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.67	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.61	□□□□□ -1.83
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.6	□□□□□ -1.83
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.6	□□□□□ -1.83
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0D9SG42	100 aa		3.59	□□□□□ -1.83
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.58	□□□□□ -1.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.53	□□□□□ -1.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.52	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.51	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.5	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1E	P04732	61 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.48	□□□□□ -1.85
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1G	P13640	62 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KIFC3-231	ENST00000567479	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TNP1	P09430	55 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.36	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1M	Q8N339	61 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1L	Q93083	61 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KIFC3-231	ENST00000567479	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KIFC3-231	ENST00000567479	MT4	P47944	62 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.18	□□□□□ -1.9
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
KIFC3-231	ENST00000567479	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.14	□□□□□ -1.91
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	INE1	O15225	51 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.98	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		2.97	□□□□□ -1.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.93	□□□□□ -1.94
KIFC3-231	ENST00000567479	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.89	□□□□□ -1.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1A	P04731	61 aa		2.84	□□□□□ -1.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.82	□□□□□ -1.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MT3	P25713	68 aa		2.81	□□□□□ -1.96
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.78	□□□□□ -1.96
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		2.77	□□□□□ -1.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.71	□□□□□ -1.98
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.67	□□□□□ -1.98
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.66	□□□□□ -1.98
KIFC3-231	ENST00000567479	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.6	□□□□□ -1.99
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.5	□□□□□ -2.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.49	□□□□□ -2.01
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.48	□□□□□ -2.01
KIFC3-231	ENST00000567479	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.41	□□□□□ -2.02
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.27	□□□□□ -2.05
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.24	□□□□□ -2.05
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.23	□□□□□ -2.05
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.14	□□□□□ -2.07
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.05	□□□□□ -2.08
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
KIFC3-231	ENST00000567479	PRM1	P04553	51 aa		1.92	□□□□□ -2.1
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.86	□□□□□ -2.11
KIFC3-231	ENST00000567479	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.79	□□□□□ -2.12
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.71	□□□□□ -2.14
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.58	□□□□□ -2.16
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.36	□□□□□ -2.19
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.19	□□□□□ -2.22

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