RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1E	P04732	61 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAC1	Q96KF2	57 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1G	P13640	62 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ROMO1	P60602	79 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.82	□□□□□ -1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		7.82	□□□□□ -1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE3A	Q5TA76	89 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1L	Q93083	61 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TNP1	P09430	55 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1M	Q8N339	61 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.46	□□□□□ -1.21
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MT4	P47944	62 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7	□□□□□ -1.29
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BS24	57 aa		6.89	□□□□□ -1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.88	□□□□□ -1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.87	□□□□□ -1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.87	□□□□□ -1.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.77	□□□□□ -1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF8	A1L188	74 aa		6.72	□□□□□ -1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1A	P04731	61 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.51	□□□□□ -1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.39	□□□□□ -1.39
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0A0MQY5	61 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MT3	P25713	68 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	INE1	O15225	51 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PRM1	P04553	51 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.95	□□□□□ -1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.72	□□□□□ -1.97

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms