RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 TNP1P09430 55 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-208ENST00000558773 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.8□□□□□ -1.32
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.76□□□□□ -1.33
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP12-3P60328 96 aa6.73□□□□□ -1.33
MFGE8-208ENST00000558773 PRR15LQ9BU68 103 aa6.69□□□□□ -1.34
MFGE8-208ENST00000558773 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.67□□□□□ -1.34
MFGE8-208ENST00000558773 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.62□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.59□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC179H3BU77 68 aa6.58□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.58□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.57□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.54□□□□□ -1.36
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MFGE8-208ENST00000558773 H3BS24 57 aa6.47□□□□□ -1.37
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP12-4P60329 112 aa6.44□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.44□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.39□□□□□ -1.39
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MFGE8-208ENST00000558773 TMEM258P61165 79 aa6.3□□□□□ -1.4
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.23□□□□□ -1.41
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.22□□□□□ -1.41
MFGE8-208ENST00000558773 K7ERS5 55 aa6.21□□□□□ -1.42
MFGE8-208ENST00000558773 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.19□□□□□ -1.42
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 MT1AP04731 61 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 PSPHP1O15172 72 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 V9GYY9 64 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-208ENST00000558773 Q1T7F1 81 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-208ENST00000558773 PCP4P48539 62 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.89□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-8O75690 187 aa5.88□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.87□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.86□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 A6NED7 52 aa5.8□□□□□ -1.48
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.8□□□□□ -1.48
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MFGE8-208ENST00000558773 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.76□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 MUC5ACP98088 5654 aa5.73□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-208ENST00000558773 MT3P25713 68 aa5.54□□□□□ -1.52
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.49□□□□□ -1.53
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MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
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MFGE8-208ENST00000558773 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.54□□□□□ -2
MFGE8-208ENST00000558773 INE1O15225 51 aa2.51□□□□□ -2.01
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