RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.87□□□□□ -1.31
RPS6KL1-216ENST00000557413 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.71□□□□□ -1.33
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KL1-216ENST00000557413 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1GP13640 62 aa6.65□□□□□ -1.35
RPS6KL1-216ENST00000557413 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1MQ8N339 61 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP12-4P60329 112 aa6.39□□□□□ -1.39
RPS6KL1-216ENST00000557413 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPS6KL1-216ENST00000557413 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.24□□□□□ -1.41
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE3BQ5TA77 95 aa6.2□□□□□ -1.42
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-9P26371 169 aa6.07□□□□□ -1.44
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT1AP04731 61 aa6.04□□□□□ -1.44
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.02□□□□□ -1.45
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.95□□□□□ -1.46
RPS6KL1-216ENST00000557413 MDN1Q9NU22 5596 aa5.92□□□□□ -1.46
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.9□□□□□ -1.47
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.87□□□□□ -1.47
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.83□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPRR2EP22531 72 aa5.82□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPRR2BP35325 72 aa5.82□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPRR2AP35326 72 aa5.82□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.79□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRM1P04553 51 aa5.67□□□□□ -1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPRR2DP22532 72 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEBP20929 6669 aa5.52□□□□□ -1.53
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.46□□□□□ -1.54
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT3P25713 68 aa5.33□□□□□ -1.56
RPS6KL1-216ENST00000557413 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.31□□□□□ -1.56
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.15□□□□□ -1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.12□□□□□ -1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE4AQ5TA78 99 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 MT4P47944 62 aa4.88□□□□□ -1.63
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1DQ5T752 114 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS6KL1-216ENST00000557413 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.74□□□□□ -1.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.68□□□□□ -1.66
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1EQ5T753 118 aa4.64□□□□□ -1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC5ACP98088 5654 aa4.54□□□□□ -1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1FQ5T754 118 aa4.51□□□□□ -1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.2□□□□□ -1.74
RPS6KL1-216ENST00000557413 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.16□□□□□ -1.74
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS6KL1-216ENST00000557413 LCE1CQ5T751 118 aa4.06□□□□□ -1.76
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-8O75690 187 aa3.96□□□□□ -1.77
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.87□□□□□ -1.79
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.81□□□□□ -1.8
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS6KL1-216ENST00000557413 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.56□□□□□ -1.84
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.46□□□□□ -1.85
RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.27□□□□□ -1.89
RPS6KL1-216ENST00000557413 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 PHGR1C9JFL3 82 aa3□□□□□ -1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.5 ms