RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT1GP13640 62 aa7.07□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A6NED7 52 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE1DQ5T752 114 aa7.06□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7ERS5 55 aa7.04□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.03□□□□□ -1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PP632Q6XCG6 107 aa7.01□□□□□ -1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE4AQ5TA78 99 aa6.99□□□□□ -1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE3AQ5TA76 89 aa6.96□□□□□ -1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.93□□□□□ -1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT4P47944 62 aa6.93□□□□□ -1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT1MQ8N339 61 aa6.91□□□□□ -1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.89□□□□□ -1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.89□□□□□ -1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.87□□□□□ -1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.87□□□□□ -1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT1LQ93083 61 aa6.85□□□□□ -1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.8□□□□□ -1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP12-3P60328 96 aa6.74□□□□□ -1.33
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.74□□□□□ -1.33
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.73□□□□□ -1.33
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BS24 57 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROMO1P60602 79 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.53□□□□□ -1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.51□□□□□ -1.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.49□□□□□ -1.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.45□□□□□ -1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.43□□□□□ -1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRK1Q8WUW1 75 aa6.42□□□□□ -1.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP12-4P60329 112 aa6.32□□□□□ -1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.29□□□□□ -1.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.21□□□□□ -1.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PMAIP1Q13794 54 aa6.06□□□□□ -1.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6□□□□□ -1.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.96□□□□□ -1.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.91□□□□□ -1.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRO0628Q9UI54 55 aa5.91□□□□□ -1.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.89□□□□□ -1.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT1AP04731 61 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAC1Q96KF2 57 aa5.78□□□□□ -1.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-8O75690 187 aa5.76□□□□□ -1.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC5ACP98088 5654 aa5.74□□□□□ -1.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.7□□□□□ -1.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.62□□□□□ -1.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.58□□□□□ -1.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.38□□□□□ -1.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT3P25713 68 aa5.37□□□□□ -1.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.34□□□□□ -1.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SVIPQ8NHG7 77 aa5.21□□□□□ -1.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE1EQ5T753 118 aa5.03□□□□□ -1.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LUZP6Q538Z0 58 aa4.76□□□□□ -1.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.73□□□□□ -1.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE1CQ5T751 118 aa4.66□□□□□ -1.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.53□□□□□ -1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0A0MQY5 61 aa4.36□□□□□ -1.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.32□□□□□ -1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCE1FQ5T754 118 aa4.23□□□□□ -1.73
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.23□□□□□ -1.73
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFAF8A1L188 74 aa4.15□□□□□ -1.75
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHGR1C9JFL3 82 aa3.94□□□□□ -1.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.84□□□□□ -1.79
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.53□□□□□ -1.84
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRM1P04553 51 aa3.42□□□□□ -1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INE1O15225 51 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.01□□□□□ -1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms