RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT1L	Q93083	61 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT1G	P13640	62 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SDR39U1-208	ENST00000554698	BRK1	Q8WUW1	75 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT1M	Q8N339	61 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SDR39U1-208	ENST00000554698	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SDR39U1-208	ENST00000554698	PMAIP1	Q13794	54 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRO0628	Q9UI54	55 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.95	□□□□□ -1.3
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SDR39U1-208	ENST00000554698	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.89	□□□□□ -1.31
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT4	P47944	62 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SDR39U1-208	ENST00000554698	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SDR39U1-208	ENST00000554698	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SDR39U1-208	ENST00000554698	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT1A	P04731	61 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SDR39U1-208	ENST00000554698	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT3	P25713	68 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SDR39U1-208	ENST00000554698	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SDR39U1-208	ENST00000554698	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SDR39U1-208	ENST00000554698	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SDR39U1-208	ENST00000554698		H3BS24	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SDR39U1-208	ENST00000554698	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A0A0MQY5	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SDR39U1-208	ENST00000554698	INE1	O15225	51 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRM1	P04553	51 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SDR39U1-208	ENST00000554698	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SDR39U1-208	ENST00000554698	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SDR39U1-208	ENST00000554698	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.45	□□□□□ -2.02

Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms