RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.44□□□□□ -1.86
AC004801.5-201ENST00000552958 A6NED7 52 aa3.43□□□□□ -1.86
AC004801.5-201ENST00000552958 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.42□□□□□ -1.86
AC004801.5-201ENST00000552958 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.4□□□□□ -1.86
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.39□□□□□ -1.87
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE1DQ5T752 114 aa3.36□□□□□ -1.87
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE3AQ5TA76 89 aa3.36□□□□□ -1.87
AC004801.5-201ENST00000552958 MT1GP13640 62 aa3.33□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 MT4P47944 62 aa3.33□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.33□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.33□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.32□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.32□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 MT1MQ8N339 61 aa3.31□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 MT1LQ93083 61 aa3.28□□□□□ -1.88
AC004801.5-201ENST00000552958 PP632Q6XCG6 107 aa3.27□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE4AQ5TA78 99 aa3.26□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.24□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP12-3P60328 96 aa3.24□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.24□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 ROMO1P60602 79 aa3.23□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.23□□□□□ -1.89
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.2□□□□□ -1.9
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.2□□□□□ -1.9
AC004801.5-201ENST00000552958 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.18□□□□□ -1.9
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.13□□□□□ -1.91
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.11□□□□□ -1.91
AC004801.5-201ENST00000552958 BRK1Q8WUW1 75 aa3.11□□□□□ -1.91
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.09□□□□□ -1.91
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.05□□□□□ -1.92
AC004801.5-201ENST00000552958 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.03□□□□□ -1.92
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.01□□□□□ -1.93
AC004801.5-201ENST00000552958 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP12-4P60329 112 aa2.96□□□□□ -1.94
AC004801.5-201ENST00000552958 PMAIP1Q13794 54 aa2.95□□□□□ -1.94
AC004801.5-201ENST00000552958 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
AC004801.5-201ENST00000552958 MUC5ACP98088 5654 aa2.92□□□□□ -1.94
AC004801.5-201ENST00000552958 PRO0628Q9UI54 55 aa2.85□□□□□ -1.95
AC004801.5-201ENST00000552958 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.82□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.81□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.81□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.79□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 PRAC1Q96KF2 57 aa2.79□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 MT1AP04731 61 aa2.78□□□□□ -1.96
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-8O75690 187 aa2.74□□□□□ -1.97
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.71□□□□□ -1.98
AC004801.5-201ENST00000552958 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.7□□□□□ -1.98
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.7□□□□□ -1.98
AC004801.5-201ENST00000552958 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.68□□□□□ -1.98
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.6□□□□□ -1.99
AC004801.5-201ENST00000552958 MT3P25713 68 aa2.54□□□□□ -2
AC004801.5-201ENST00000552958 SVIPQ8NHG7 77 aa2.54□□□□□ -2
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.53□□□□□ -2
AC004801.5-201ENST00000552958 LUZP6Q538Z0 58 aa2.35□□□□□ -2.03
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE1EQ5T753 118 aa2.33□□□□□ -2.04
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.29□□□□□ -2.04
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.27□□□□□ -2.05
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.21□□□□□ -2.06
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE1CQ5T751 118 aa2.17□□□□□ -2.06
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.17□□□□□ -2.06
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.1□□□□□ -2.07
AC004801.5-201ENST00000552958 NDUFAF8A1L188 74 aa2.01□□□□□ -2.09
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.98□□□□□ -2.09
AC004801.5-201ENST00000552958 PHGR1C9JFL3 82 aa1.96□□□□□ -2.1
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
AC004801.5-201ENST00000552958 LCE1FQ5T754 118 aa1.92□□□□□ -2.1
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.85□□□□□ -2.11
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.78□□□□□ -2.12
AC004801.5-201ENST00000552958 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.71□□□□□ -2.14
AC004801.5-201ENST00000552958 A0A0A0MQY5 61 aa1.67□□□□□ -2.14
AC004801.5-201ENST00000552958 INE1O15225 51 aa1.66□□□□□ -2.14
AC004801.5-201ENST00000552958 PRM1P04553 51 aa1.66□□□□□ -2.14
AC004801.5-201ENST00000552958 H3BS24 57 aa1.49□□□□□ -2.17
AC004801.5-201ENST00000552958 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.47□□□□□ -2.17
AC004801.5-201ENST00000552958 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms