RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550407.1

TARBP2-215, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-215	ENST00000550407	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TARBP2-215	ENST00000550407	SPRR2D	P22532	72 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.4	□□□□□ -1.54
TARBP2-215	ENST00000550407	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.39	□□□□□ -1.55
TARBP2-215	ENST00000550407	MT1E	P04732	61 aa		5.38	□□□□□ -1.55
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TARBP2-215	ENST00000550407	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP2-215	ENST00000550407	MT1L	Q93083	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP2-215	ENST00000550407	MT1G	P13640	62 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TARBP2-215	ENST00000550407	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TARBP2-215	ENST00000550407	MT1M	Q8N339	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TARBP2-215	ENST00000550407	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TARBP2-215	ENST00000550407	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARBP2-215	ENST00000550407	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARBP2-215	ENST00000550407	MT4	P47944	62 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TARBP2-215	ENST00000550407	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TARBP2-215	ENST00000550407	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TARBP2-215	ENST00000550407	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TARBP2-215	ENST00000550407	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TARBP2-215	ENST00000550407	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
TARBP2-215	ENST00000550407	MT1A	P04731	61 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TARBP2-215	ENST00000550407	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TARBP2-215	ENST00000550407	MT3	P25713	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TARBP2-215	ENST00000550407	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TARBP2-215	ENST00000550407	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TARBP2-215	ENST00000550407	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TARBP2-215	ENST00000550407	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TARBP2-215	ENST00000550407		A0A0A0MQY5	61 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TARBP2-215	ENST00000550407	INE1	O15225	51 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TARBP2-215	ENST00000550407		H3BS24	57 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TARBP2-215	ENST00000550407	PRM1	P04553	51 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TARBP2-215	ENST00000550407	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TARBP2-215	ENST00000550407	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.58	□□□□□ -2
TARBP2-215	ENST00000550407	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TARBP2-215	ENST00000550407	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.96	□□□□□ -2.1
TARBP2-215	ENST00000550407	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.73	□□□□□ -2.13

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