RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 TNP1P09430 55 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-218ENST00000550159 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-218ENST00000550159 ROMO1P60602 79 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-218ENST00000550159 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-218ENST00000550159 LCE1DQ5T752 114 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-218ENST00000550159 KRTAP10-12P60413 245 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-218ENST00000550159 PMAIP1Q13794 54 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-218ENST00000550159 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-218ENST00000550159 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-218ENST00000550159 PRO0628Q9UI54 55 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-218ENST00000550159 PP632Q6XCG6 107 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-218ENST00000550159 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-218ENST00000550159 LCE3AQ5TA76 89 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-218ENST00000550159 KRTAP12-3P60328 96 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 LCE4AQ5TA78 99 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 MT4P47944 62 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-218ENST00000550159 MT1EP04732 61 aa3.51□□□□□ -1.85
CS-218ENST00000550159 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.51□□□□□ -1.85
CS-218ENST00000550159 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-218ENST00000550159 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-218ENST00000550159 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-218ENST00000550159 MT1GP13640 62 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-218ENST00000550159 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-218ENST00000550159 PRAC1Q96KF2 57 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-218ENST00000550159 MT1LQ93083 61 aa3.4□□□□□ -1.87
CS-218ENST00000550159 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-218ENST00000550159 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CS-218ENST00000550159 MT1MQ8N339 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-218ENST00000550159 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.26□□□□□ -1.89
CS-218ENST00000550159 MUC5ACP98088 5654 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-218ENST00000550159 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.15□□□□□ -1.91
CS-218ENST00000550159 H3BS24 57 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-218ENST00000550159 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-218ENST00000550159 LUZP6Q538Z0 58 aa3.1□□□□□ -1.91
CS-218ENST00000550159 KRTAP12-4P60329 112 aa3.02□□□□□ -1.93
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
CS-218ENST00000550159 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-8O75690 187 aa2.95□□□□□ -1.94
CS-218ENST00000550159 MT1AP04731 61 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-218ENST00000550159 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-218ENST00000550159 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-218ENST00000550159 A0A0A0MQY5 61 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-218ENST00000550159 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-218ENST00000550159 MT3P25713 68 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-218ENST00000550159 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-218ENST00000550159 NDUFAF8A1L188 74 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.58□□□□□ -2
CS-218ENST00000550159 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-218ENST00000550159 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-218ENST00000550159 LCE1EQ5T753 118 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-218ENST00000550159 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.39□□□□□ -2.03
CS-218ENST00000550159 INE1O15225 51 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-218ENST00000550159 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-218ENST00000550159 LCE1CQ5T751 118 aa2.22□□□□□ -2.05
CS-218ENST00000550159 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-218ENST00000550159 PHGR1C9JFL3 82 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-218ENST00000550159 LCE1FQ5T754 118 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-218ENST00000550159 PRM1P04553 51 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-218ENST00000550159 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-218ENST00000550159 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.79□□□□□ -2.12
CS-218ENST00000550159 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.64□□□□□ -2.15
CS-218ENST00000550159 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.19□□□□□ -2.22
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