RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.82	□□□□□ -1.48
DDX11-222	ENST00000542777	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DDX11-222	ENST00000542777	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DDX11-222	ENST00000542777	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DDX11-222	ENST00000542777	MT4	P47944	62 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DDX11-222	ENST00000542777	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DDX11-222	ENST00000542777	MT1M	Q8N339	61 aa		5.72	□□□□□ -1.49
DDX11-222	ENST00000542777		A6NED7	52 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DDX11-222	ENST00000542777	MT1L	Q93083	61 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DDX11-222	ENST00000542777	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.59	□□□□□ -1.51
DDX11-222	ENST00000542777	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.57	□□□□□ -1.52
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.55	□□□□□ -1.52
DDX11-222	ENST00000542777	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.55	□□□□□ -1.52
DDX11-222	ENST00000542777	TNP1	P09430	55 aa		5.54	□□□□□ -1.52
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.53	□□□□□ -1.52
DDX11-222	ENST00000542777		K7ERS5	55 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DDX11-222	ENST00000542777	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.41	□□□□□ -1.54
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DDX11-222	ENST00000542777	ROMO1	P60602	79 aa		5.31	□□□□□ -1.56
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.3	□□□□□ -1.56
DDX11-222	ENST00000542777	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.27	□□□□□ -1.57
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DDX11-222	ENST00000542777	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.17	□□□□□ -1.58
DDX11-222	ENST00000542777	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DDX11-222	ENST00000542777	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DDX11-222	ENST00000542777	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX11-222	ENST00000542777	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX11-222	ENST00000542777	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX11-222	ENST00000542777	MT1A	P04731	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDX11-222	ENST00000542777	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDX11-222	ENST00000542777	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX11-222	ENST00000542777	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDX11-222	ENST00000542777	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDX11-222	ENST00000542777	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX11-222	ENST00000542777	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX11-222	ENST00000542777	MT3	P25713	68 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDX11-222	ENST00000542777	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DDX11-222	ENST00000542777	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DDX11-222	ENST00000542777	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.92	□□□□□ -1.78
DDX11-222	ENST00000542777	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.83	□□□□□ -1.8
DDX11-222	ENST00000542777	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.81	□□□□□ -1.8
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DDX11-222	ENST00000542777	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.48	□□□□□ -1.85
DDX11-222	ENST00000542777	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
DDX11-222	ENST00000542777	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DDX11-222	ENST00000542777	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.24	□□□□□ -1.89
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DDX11-222	ENST00000542777	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.83	□□□□□ -1.96
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0A0MQY5	61 aa		2.79	□□□□□ -1.96
DDX11-222	ENST00000542777	PRM1	P04553	51 aa		2.78	□□□□□ -1.96
DDX11-222	ENST00000542777	INE1	O15225	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.46	□□□□□ -2.02
DDX11-222	ENST00000542777		H3BS24	57 aa		2.12	□□□□□ -2.07
DDX11-222	ENST00000542777	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.02	□□□□□ -2.09

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms