RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.35□□□□□ -1.55
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.35□□□□□ -1.55
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.35□□□□□ -1.55
TSTA3-216ENST00000533817 LCE3BQ5TA77 95 aa5.34□□□□□ -1.55
TSTA3-216ENST00000533817 MT1LQ93083 61 aa5.31□□□□□ -1.56
TSTA3-216ENST00000533817 MT1GP13640 62 aa5.3□□□□□ -1.56
TSTA3-216ENST00000533817 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.29□□□□□ -1.56
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP12-3P60328 96 aa5.25□□□□□ -1.57
TSTA3-216ENST00000533817 PP632Q6XCG6 107 aa5.23□□□□□ -1.57
TSTA3-216ENST00000533817 MT1MQ8N339 61 aa5.23□□□□□ -1.57
TSTA3-216ENST00000533817 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TSTA3-216ENST00000533817 PRO0628Q9UI54 55 aa5.2□□□□□ -1.58
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.18□□□□□ -1.58
TSTA3-216ENST00000533817 ROMO1P60602 79 aa5.17□□□□□ -1.58
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.11□□□□□ -1.59
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.07□□□□□ -1.6
TSTA3-216ENST00000533817 BRK1Q8WUW1 75 aa5□□□□□ -1.61
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.98□□□□□ -1.61
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.96□□□□□ -1.62
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.9□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 PMAIP1Q13794 54 aa4.89□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 LCE4AQ5TA78 99 aa4.89□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.87□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.86□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 LCE1DQ5T752 114 aa4.84□□□□□ -1.63
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TSTA3-216ENST00000533817 MT4P47944 62 aa4.79□□□□□ -1.64
TSTA3-216ENST00000533817 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.78□□□□□ -1.64
TSTA3-216ENST00000533817 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.78□□□□□ -1.64
TSTA3-216ENST00000533817 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.73□□□□□ -1.65
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.7□□□□□ -1.66
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.61□□□□□ -1.67
TSTA3-216ENST00000533817 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.6□□□□□ -1.67
TSTA3-216ENST00000533817 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.57□□□□□ -1.68
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.57□□□□□ -1.68
TSTA3-216ENST00000533817 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP12-4P60329 112 aa4.56□□□□□ -1.68
TSTA3-216ENST00000533817 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.55□□□□□ -1.68
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TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.48□□□□□ -1.69
TSTA3-216ENST00000533817 PRAC1Q96KF2 57 aa4.45□□□□□ -1.7
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.44□□□□□ -1.7
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.38□□□□□ -1.71
TSTA3-216ENST00000533817 H3BS24 57 aa4.33□□□□□ -1.72
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.33□□□□□ -1.72
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.31□□□□□ -1.72
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.22□□□□□ -1.73
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.18□□□□□ -1.74
TSTA3-216ENST00000533817 MT3P25713 68 aa4.11□□□□□ -1.75
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.1□□□□□ -1.75
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-8O75690 187 aa3.97□□□□□ -1.77
TSTA3-216ENST00000533817 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.96□□□□□ -1.78
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.82□□□□□ -1.8
TSTA3-216ENST00000533817 MUC5ACP98088 5654 aa3.76□□□□□ -1.81
TSTA3-216ENST00000533817 A0A0A0MQY5 61 aa3.74□□□□□ -1.81
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TSTA3-216ENST00000533817 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.54□□□□□ -1.84
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.52□□□□□ -1.85
TSTA3-216ENST00000533817 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.47□□□□□ -1.85
TSTA3-216ENST00000533817 LCE1CQ5T751 118 aa3.46□□□□□ -1.86
TSTA3-216ENST00000533817 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.37□□□□□ -1.87
TSTA3-216ENST00000533817 INE1O15225 51 aa3.22□□□□□ -1.89
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.08□□□□□ -1.92
TSTA3-216ENST00000533817 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.95□□□□□ -1.94
TSTA3-216ENST00000533817 PHGR1C9JFL3 82 aa2.68□□□□□ -1.98
TSTA3-216ENST00000533817 PRM1P04553 51 aa2.66□□□□□ -1.98
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.66□□□□□ -1.98
TSTA3-216ENST00000533817 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.41□□□□□ -2.02
TSTA3-216ENST00000533817 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.91□□□□□ -2.1
TSTA3-216ENST00000533817 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 3172.8 ms