RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CHID1-222	ENST00000533059	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHID1-222	ENST00000533059	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHID1-222	ENST00000533059	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHID1-222	ENST00000533059	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5	□□□□□ -1.61
CHID1-222	ENST00000533059	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHID1-222	ENST00000533059	MT1G	P13640	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHID1-222	ENST00000533059	MT1L	Q93083	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHID1-222	ENST00000533059		H3BS24	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHID1-222	ENST00000533059	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHID1-222	ENST00000533059	MT1M	Q8N339	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHID1-222	ENST00000533059	ROMO1	P60602	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHID1-222	ENST00000533059	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHID1-222	ENST00000533059	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHID1-222	ENST00000533059	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHID1-222	ENST00000533059	MT4	P47944	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0A0MQY5	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHID1-222	ENST00000533059	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CHID1-222	ENST00000533059	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CHID1-222	ENST00000533059	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CHID1-222	ENST00000533059	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CHID1-222	ENST00000533059	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CHID1-222	ENST00000533059	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CHID1-222	ENST00000533059	MT1A	P04731	61 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CHID1-222	ENST00000533059	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHID1-222	ENST00000533059	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CHID1-222	ENST00000533059	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CHID1-222	ENST00000533059	MT3	P25713	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CHID1-222	ENST00000533059	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CHID1-222	ENST00000533059	INE1	O15225	51 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CHID1-222	ENST00000533059	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CHID1-222	ENST00000533059	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CHID1-222	ENST00000533059	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CHID1-222	ENST00000533059	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CHID1-222	ENST00000533059	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CHID1-222	ENST00000533059	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.24	□□□□□ -1.89
CHID1-222	ENST00000533059	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CHID1-222	ENST00000533059	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.9	□□□□□ -1.95
CHID1-222	ENST00000533059	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CHID1-222	ENST00000533059	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CHID1-222	ENST00000533059	PRM1	P04553	51 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CHID1-222	ENST00000533059	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.25	□□□□□ -2.05
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.85	□□□□□ -2.11
CHID1-222	ENST00000533059	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.68	□□□□□ -2.14

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