RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532564.6

GMDS-AS1-210, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 1,436 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PLAC4Q8WY50 150 aa3.66□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.65□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.64□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 A6NN06 94 aa3.62□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP12-1P59990 96 aa3.61□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.61□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.6□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SSPOA2VEC9 5147 aa3.59□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.58□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-210ENST00000532564 K7ERS5 55 aa3.57□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-210ENST00000532564 BRK1Q8WUW1 75 aa3.57□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.53□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1XP80297 61 aa3.52□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.51□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PMAIP1Q13794 54 aa3.49□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
GMDS-AS1-210ENST00000532564 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.43□□□□□ -1.86
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ROMO1P60602 79 aa3.37□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TNP1P09430 55 aa3.36□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.32□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.31□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KMT2DO14686 5537 aa3.3□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.23□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE1CQ5T751 118 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PP632Q6XCG6 107 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP12-3P60328 96 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1EP04732 61 aa3.09□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NEBP20929 6669 aa3.07□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MDN1Q9NU22 5596 aa3.05□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2EP22531 72 aa3.04□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2BP35325 72 aa3.04□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2AP35326 72 aa3.04□□□□□ -1.92
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1LQ93083 61 aa3.01□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1GP13640 62 aa2.95□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR2DP22532 72 aa2.93□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1MQ8N339 61 aa2.93□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.91□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.91□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.83□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-210ENST00000532564 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.78□□□□□ -1.96
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LUZP6Q538Z0 58 aa2.72□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-210ENST00000532564 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.71□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-8O75690 187 aa2.68□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.65□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT1AP04731 61 aa2.56□□□□□ -2
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MT4P47944 62 aa2.56□□□□□ -2
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.54□□□□□ -2
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.53□□□□□ -2
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP12-4P60329 112 aa2.51□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-210ENST00000532564 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.47□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.42□□□□□ -2.02
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.37□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-210ENST00000532564 INE1O15225 51 aa2.34□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.34□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-210ENST00000532564 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.32□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.28□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-210ENST00000532564 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC5ACP98088 5654 aa2.03□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRM1P04553 51 aa1.76□□□□□ -2.13
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PHGR1C9JFL3 82 aa1.45□□□□□ -2.18
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.11□□□□□ -2.23
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms