RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXYD2P54710 66 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA5Q16718 116 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX8AP10176 69 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLEU1O43261 78 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOC3P02656 99 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 SVBPQ8N300 66 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 C14orf144Q96I85 54 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR15LQ9BU68 103 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BPC8 53 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BKO60814 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BJP06899 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BOP23527 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BBP33778 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BDP58876 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BCP62807 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSD52Q0P140 79 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H2BEQ16778 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BHQ93079 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BNQ99877 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2BMQ99879 126 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BT86 120 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A2P29034 98 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GU69 56 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ERS5 55 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A1P23297 94 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 OCR1Q9BZK8 76 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A6P06703 90 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 COA5Q86WW8 74 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0R143 59 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFAF8A1L188 74 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCR11O14957 56 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNURFQ9Y675 71 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRM1P04553 51 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 ROMO1P60602 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM20Q8N5G0 67 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-548P-201ENST00000517083 F8W1H4 67 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q1T7F1 81 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM6P0DI80 62 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-548P-201ENST00000517083 A6NED7 52 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QR89 54 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSPHP1O15172 72 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM258P61165 79 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYY9 64 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX7CP15954 63 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GV90 55 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ERU9 68 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC179H3BU77 68 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SVIPQ8NHG7 77 aa-0.53□□□□□ -2.49
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PCP4P48539 62 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0A0MQY5 61 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-548P-201ENST00000517083 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRO0628Q9UI54 55 aa-0.82□□□□□ -2.54
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