RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2EP22531 72 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2BP35325 72 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2AP35326 72 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 MT1XP80297 61 aa4.68□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 BRK1Q8WUW1 75 aa4.68□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 MDN1Q9NU22 5596 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2B-208ENST00000511807 PRO0628Q9UI54 55 aa4.63□□□□□ -1.67
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.6□□□□□ -1.67
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2DP22532 72 aa4.55□□□□□ -1.68
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.52□□□□□ -1.69
UBE2B-208ENST00000511807 TNP1P09430 55 aa4.48□□□□□ -1.69
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-12P60413 245 aa4.45□□□□□ -1.7
UBE2B-208ENST00000511807 ROMO1P60602 79 aa4.44□□□□□ -1.7
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.42□□□□□ -1.7
UBE2B-208ENST00000511807 PMAIP1Q13794 54 aa4.4□□□□□ -1.71
UBE2B-208ENST00000511807 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.29□□□□□ -1.72
UBE2B-208ENST00000511807 LCE3AQ5TA76 89 aa4.27□□□□□ -1.73
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
UBE2B-208ENST00000511807 PP632Q6XCG6 107 aa4.23□□□□□ -1.73
UBE2B-208ENST00000511807 PRAC1Q96KF2 57 aa4.22□□□□□ -1.73
UBE2B-208ENST00000511807 MT3P25713 68 aa4.21□□□□□ -1.74
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.18□□□□□ -1.74
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.18□□□□□ -1.74
UBE2B-208ENST00000511807 MT1EP04732 61 aa4.16□□□□□ -1.74
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.16□□□□□ -1.74
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP12-3P60328 96 aa4.14□□□□□ -1.75
UBE2B-208ENST00000511807 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
UBE2B-208ENST00000511807 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.11□□□□□ -1.75
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.08□□□□□ -1.76
UBE2B-208ENST00000511807 MT1GP13640 62 aa4.04□□□□□ -1.76
UBE2B-208ENST00000511807 MT4P47944 62 aa4.01□□□□□ -1.77
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFAF8A1L188 74 aa4□□□□□ -1.77
UBE2B-208ENST00000511807 MT1LQ93083 61 aa4□□□□□ -1.77
UBE2B-208ENST00000511807 MT1MQ8N339 61 aa3.97□□□□□ -1.77
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.9□□□□□ -1.79
UBE2B-208ENST00000511807 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.88□□□□□ -1.79
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1FQ5T754 118 aa3.86□□□□□ -1.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.86□□□□□ -1.79
UBE2B-208ENST00000511807 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.85□□□□□ -1.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.83□□□□□ -1.8
UBE2B-208ENST00000511807 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.78□□□□□ -1.81
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1EQ5T753 118 aa3.76□□□□□ -1.81
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.71□□□□□ -1.82
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.68□□□□□ -1.82
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.66□□□□□ -1.82
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.63□□□□□ -1.83
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP12-4P60329 112 aa3.62□□□□□ -1.83
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.57□□□□□ -1.84
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-208ENST00000511807 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
UBE2B-208ENST00000511807 LUZP6Q538Z0 58 aa3.44□□□□□ -1.86
UBE2B-208ENST00000511807 MT1AP04731 61 aa3.43□□□□□ -1.86
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-8O75690 187 aa3.29□□□□□ -1.88
UBE2B-208ENST00000511807 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.24□□□□□ -1.89
UBE2B-208ENST00000511807 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.21□□□□□ -1.9
UBE2B-208ENST00000511807 MUC5ACP98088 5654 aa3.2□□□□□ -1.9
UBE2B-208ENST00000511807 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
UBE2B-208ENST00000511807 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2B-208ENST00000511807 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.87□□□□□ -1.95
UBE2B-208ENST00000511807 INE1O15225 51 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1CQ5T751 118 aa2.65□□□□□ -1.99
UBE2B-208ENST00000511807 PHGR1C9JFL3 82 aa2.27□□□□□ -2.05
UBE2B-208ENST00000511807 PRM1P04553 51 aa2.27□□□□□ -2.05
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.2□□□□□ -2.06
UBE2B-208ENST00000511807 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.09□□□□□ -2.07
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.71□□□□□ -2.14
UBE2B-208ENST00000511807 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.9 ms