RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.17	□□□□□ -1.42
MIB2-223	ENST00000508148		K7ERS5	55 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIB2-223	ENST00000508148		A6NED7	52 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MIB2-223	ENST00000508148	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MIB2-223	ENST00000508148	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	MT1G	P13640	62 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	MT4	P47944	62 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	MT1M	Q8N339	61 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.9	□□□□□ -1.46
MIB2-223	ENST00000508148	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.88	□□□□□ -1.47
MIB2-223	ENST00000508148	MT1L	Q93083	61 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIB2-223	ENST00000508148	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	ROMO1	P60602	79 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.62	□□□□□ -1.51
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.56	□□□□□ -1.52
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MIB2-223	ENST00000508148	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIB2-223	ENST00000508148	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIB2-223	ENST00000508148	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIB2-223	ENST00000508148	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MIB2-223	ENST00000508148	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
MIB2-223	ENST00000508148	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIB2-223	ENST00000508148	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MIB2-223	ENST00000508148	MT1A	P04731	61 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5	□□□□□ -1.61
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIB2-223	ENST00000508148	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIB2-223	ENST00000508148	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIB2-223	ENST00000508148	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIB2-223	ENST00000508148	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIB2-223	ENST00000508148	MT3	P25713	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIB2-223	ENST00000508148	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIB2-223	ENST00000508148	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MIB2-223	ENST00000508148	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MIB2-223	ENST00000508148	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MIB2-223	ENST00000508148	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MIB2-223	ENST00000508148		H3BS24	57 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MIB2-223	ENST00000508148	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0A0MQY5	61 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.6	□□□□□ -1.83
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MIB2-223	ENST00000508148	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MIB2-223	ENST00000508148	INE1	O15225	51 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MIB2-223	ENST00000508148	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MIB2-223	ENST00000508148	PRM1	P04553	51 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MIB2-223	ENST00000508148	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.92	□□□□□ -1.94
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.51	□□□□□ -2.01
MIB2-223	ENST00000508148	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.12	□□□□□ -2.07

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