RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.76□□□□□ -1.49
PFKL-211ENST00000498841 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.73□□□□□ -1.49
PFKL-211ENST00000498841 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.68□□□□□ -1.5
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.68□□□□□ -1.5
PFKL-211ENST00000498841 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.66□□□□□ -1.5
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PFKL-211ENST00000498841 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PFKL-211ENST00000498841 MDN1Q9NU22 5596 aa5.54□□□□□ -1.52
PFKL-211ENST00000498841 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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PFKL-211ENST00000498841 MT1MQ8N339 61 aa5.45□□□□□ -1.54
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.43□□□□□ -1.54
PFKL-211ENST00000498841 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.34□□□□□ -1.56
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PFKL-211ENST00000498841 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.24□□□□□ -1.57
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.21□□□□□ -1.57
PFKL-211ENST00000498841 LCE3BQ5TA77 95 aa5.16□□□□□ -1.58
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PFKL-211ENST00000498841 SPRR2AP35326 72 aa5.11□□□□□ -1.59
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKL-211ENST00000498841 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.08□□□□□ -1.6
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.99□□□□□ -1.61
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-9P26371 169 aa4.92□□□□□ -1.62
PFKL-211ENST00000498841 SPRR2DP22532 72 aa4.87□□□□□ -1.63
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.79□□□□□ -1.64
PFKL-211ENST00000498841 MT1AP04731 61 aa4.77□□□□□ -1.65
PFKL-211ENST00000498841 PRM1P04553 51 aa4.74□□□□□ -1.65
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.72□□□□□ -1.65
PFKL-211ENST00000498841 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.69□□□□□ -1.66
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PFKL-211ENST00000498841 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.63□□□□□ -1.67
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PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.51□□□□□ -1.69
PFKL-211ENST00000498841 MT4P47944 62 aa4.47□□□□□ -1.69
PFKL-211ENST00000498841 NEBP20929 6669 aa4.46□□□□□ -1.7
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.38□□□□□ -1.71
PFKL-211ENST00000498841 MT3P25713 68 aa4.33□□□□□ -1.72
PFKL-211ENST00000498841 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.24□□□□□ -1.73
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.17□□□□□ -1.74
PFKL-211ENST00000498841 LCE1EQ5T753 118 aa4.14□□□□□ -1.75
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.12□□□□□ -1.75
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.09□□□□□ -1.75
PFKL-211ENST00000498841 LCE1DQ5T752 114 aa4.09□□□□□ -1.75
PFKL-211ENST00000498841 LCE4AQ5TA78 99 aa3.97□□□□□ -1.77
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.9□□□□□ -1.79
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.84□□□□□ -1.79
PFKL-211ENST00000498841 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.83□□□□□ -1.8
PFKL-211ENST00000498841 MUC5ACP98088 5654 aa3.82□□□□□ -1.8
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.8□□□□□ -1.8
PFKL-211ENST00000498841 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.75□□□□□ -1.81
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.63□□□□□ -1.83
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PFKL-211ENST00000498841 LCE1FQ5T754 118 aa3.41□□□□□ -1.86
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.4□□□□□ -1.86
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.39□□□□□ -1.87
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.36□□□□□ -1.87
PFKL-211ENST00000498841 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PFKL-211ENST00000498841 LCE1CQ5T751 118 aa3.26□□□□□ -1.89
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-8O75690 187 aa3.26□□□□□ -1.89
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.22□□□□□ -1.89
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.13□□□□□ -1.91
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.12□□□□□ -1.91
PFKL-211ENST00000498841 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.08□□□□□ -1.92
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.93□□□□□ -1.94
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.88□□□□□ -1.95
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.86□□□□□ -1.95
PFKL-211ENST00000498841 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.82□□□□□ -1.96
PFKL-211ENST00000498841 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PFKL-211ENST00000498841 PHGR1C9JFL3 82 aa2.48□□□□□ -2.01
PFKL-211ENST00000498841 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.62□□□□□ -2.15
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