RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.27□□□□□ -1.57
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.27□□□□□ -1.57
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD54-210ENST00000498417 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD54-210ENST00000498417 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.12□□□□□ -1.59
ANKRD54-210ENST00000498417 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD54-210ENST00000498417 MT1MQ8N339 61 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD54-210ENST00000498417 MT1GP13640 62 aa5.06□□□□□ -1.6
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.93□□□□□ -1.62
ANKRD54-210ENST00000498417 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.93□□□□□ -1.62
ANKRD54-210ENST00000498417 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.92□□□□□ -1.62
ANKRD54-210ENST00000498417 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ANKRD54-210ENST00000498417 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE3BQ5TA77 95 aa4.64□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.64□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP12-4P60329 112 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 MDN1Q9NU22 5596 aa4.63□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.62□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.61□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-9P26371 169 aa4.61□□□□□ -1.67
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD54-210ENST00000498417 MT1AP04731 61 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD54-210ENST00000498417 SPRR2EP22531 72 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD54-210ENST00000498417 SPRR2BP35325 72 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD54-210ENST00000498417 SPRR2AP35326 72 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD54-210ENST00000498417 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.36□□□□□ -1.71
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD54-210ENST00000498417 SPRR2DP22532 72 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.22□□□□□ -1.73
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.17□□□□□ -1.74
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD54-210ENST00000498417 PRM1P04553 51 aa4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54-210ENST00000498417 MT3P25713 68 aa4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD54-210ENST00000498417 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.96□□□□□ -1.78
ANKRD54-210ENST00000498417 NEBP20929 6669 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD54-210ENST00000498417 MT4P47944 62 aa3.8□□□□□ -1.8
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.74□□□□□ -1.81
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.72□□□□□ -1.81
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE4AQ5TA78 99 aa3.72□□□□□ -1.81
ANKRD54-210ENST00000498417 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.6□□□□□ -1.83
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1DQ5T752 114 aa3.59□□□□□ -1.84
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.58□□□□□ -1.84
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.58□□□□□ -1.84
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.47□□□□□ -1.85
ANKRD54-210ENST00000498417 MUC5ACP98088 5654 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1EQ5T753 118 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1FQ5T754 118 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.19□□□□□ -1.9
ANKRD54-210ENST00000498417 LCE1CQ5T751 118 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.01□□□□□ -1.93
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.92□□□□□ -1.94
ANKRD54-210ENST00000498417 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.84□□□□□ -1.95
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD54-210ENST00000498417 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.57□□□□□ -2
ANKRD54-210ENST00000498417 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.5□□□□□ -2.01
ANKRD54-210ENST00000498417 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.46□□□□□ -2.02
ANKRD54-210ENST00000498417 PHGR1C9JFL3 82 aa2.37□□□□□ -2.03
ANKRD54-210ENST00000498417 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
ANKRD54-210ENST00000498417 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.56□□□□□ -2.16
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