RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1HP80294 61 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP10-10P60014 251 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-214ENST00000497648 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R2T5 61 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-214ENST00000497648 USH2AO75445 5202 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-214ENST00000497648 TNP1P09430 55 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-9P26371 169 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-214ENST00000497648 SSPOA2VEC9 5147 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MT2AP02795 61 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1FP04733 61 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-214ENST00000497648 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-214ENST00000497648 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP12-4P60329 112 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-214ENST00000497648 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE3AQ5TA76 89 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1BP07438 61 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-214ENST00000497648 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-214ENST00000497648 KMT2DO14686 5537 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-214ENST00000497648 NEBP20929 6669 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.02□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1XP80297 61 aa2.98□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP12-3P60328 96 aa2.96□□□□□ -1.93
RABGGTB-214ENST00000497648 MDN1Q9NU22 5596 aa2.96□□□□□ -1.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE1CQ5T751 118 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2EP22531 72 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2BP35325 72 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2AP35326 72 aa2.7□□□□□ -1.98
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.68□□□□□ -1.98
RABGGTB-214ENST00000497648 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.64□□□□□ -1.99
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1EP04732 61 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR2DP22532 72 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-214ENST00000497648 PRM1P04553 51 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1LQ93083 61 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-8O75690 187 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1MQ8N339 61 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-214ENST00000497648 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1GP13640 62 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-214ENST00000497648 MT1AP04731 61 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.34□□□□□ -2.04
RABGGTB-214ENST00000497648 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-214ENST00000497648 MT4P47944 62 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.28□□□□□ -2.05
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC5ACP98088 5654 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-214ENST00000497648 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.91□□□□□ -2.1
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
RABGGTB-214ENST00000497648 PHGR1C9JFL3 82 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-214ENST00000497648 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 254.8 ms