RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1G	P13640	62 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PSPHP1	O15172	72 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246		Q1T7F1	81 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NED7	52 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTLL3-231	ENST00000496246	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1L	Q93083	61 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4	□□□□□ -1.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1M	Q8N339	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TTLL3-231	ENST00000496246	ROMO1	P60602	79 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MT4	P47944	62 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTLL3-231	ENST00000496246	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTLL3-231	ENST00000496246	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TTLL3-231	ENST00000496246	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TTLL3-231	ENST00000496246	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1A	P04731	61 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TTLL3-231	ENST00000496246	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTLL3-231	ENST00000496246	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTLL3-231	ENST00000496246	MT3	P25713	68 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTLL3-231	ENST00000496246	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTLL3-231	ENST00000496246	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.9	□□□□□ -1.95
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
TTLL3-231	ENST00000496246	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.83	□□□□□ -1.96
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.56	□□□□□ -2
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.42	□□□□□ -2.02
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.41	□□□□□ -2.02
TTLL3-231	ENST00000496246	INE1	O15225	51 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TTLL3-231	ENST00000496246	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.09	□□□□□ -2.07
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.02	□□□□□ -2.09
TTLL3-231	ENST00000496246	PRM1	P04553	51 aa		1.93	□□□□□ -2.1
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.9	□□□□□ -2.11
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.61	□□□□□ -2.15
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.31	□□□□□ -2.2

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms