RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-212ENST00000492539 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-212ENST00000492539 MT1GP13640 62 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-212ENST00000492539 TNP1P09430 55 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 LCE4AQ5TA78 99 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 A6NED7 52 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 K7ERS5 55 aa7.18□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 PP632Q6XCG6 107 aa7.15□□□□□ -1.26
NELFE-212ENST00000492539 MT4P47944 62 aa7.14□□□□□ -1.27
NELFE-212ENST00000492539 MT1MQ8N339 61 aa7.12□□□□□ -1.27
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NELFE-212ENST00000492539 MT1LQ93083 61 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-212ENST00000492539 LCE3AQ5TA76 89 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.97□□□□□ -1.29
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-212ENST00000492539 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.93□□□□□ -1.3
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NELFE-212ENST00000492539 ROMO1P60602 79 aa6.76□□□□□ -1.33
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NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.74□□□□□ -1.33
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NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NELFE-212ENST00000492539 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-212ENST00000492539 BRK1Q8WUW1 75 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP12-4P60329 112 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.45□□□□□ -1.38
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NELFE-212ENST00000492539 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-212ENST00000492539 MT1AP04731 61 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-212ENST00000492539 PRO0628Q9UI54 55 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-8O75690 187 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-212ENST00000492539 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-212ENST00000492539 SVIPQ8NHG7 77 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-212ENST00000492539 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFE-212ENST00000492539 MUC5ACP98088 5654 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-212ENST00000492539 PRAC1Q96KF2 57 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-212ENST00000492539 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.76□□□□□ -1.49
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-212ENST00000492539 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-212ENST00000492539 MT3P25713 68 aa5.49□□□□□ -1.53
NELFE-212ENST00000492539 H3BS24 57 aa5.31□□□□□ -1.56
NELFE-212ENST00000492539 LCE1EQ5T753 118 aa5.14□□□□□ -1.59
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.91□□□□□ -1.62
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NELFE-212ENST00000492539 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.84□□□□□ -1.63
NELFE-212ENST00000492539 LCE1CQ5T751 118 aa4.78□□□□□ -1.64
NELFE-212ENST00000492539 A0A0A0MQY5 61 aa4.62□□□□□ -1.67
NELFE-212ENST00000492539 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.59□□□□□ -1.67
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.54□□□□□ -1.68
NELFE-212ENST00000492539 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.38□□□□□ -1.71
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.37□□□□□ -1.71
NELFE-212ENST00000492539 LCE1FQ5T754 118 aa4.33□□□□□ -1.72
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
NELFE-212ENST00000492539 NDUFAF8A1L188 74 aa4.22□□□□□ -1.73
NELFE-212ENST00000492539 PHGR1C9JFL3 82 aa4.06□□□□□ -1.76
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.96□□□□□ -1.78
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.65□□□□□ -1.83
NELFE-212ENST00000492539 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.56□□□□□ -1.84
NELFE-212ENST00000492539 INE1O15225 51 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFE-212ENST00000492539 PRM1P04553 51 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.09□□□□□ -1.91
NELFE-212ENST00000492539 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.51□□□□□ -2.01
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