RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 LCE1DQ5T752 114 aa5.76□□□□□ -1.49
LAMA5-210ENST00000491036 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.74□□□□□ -1.49
LAMA5-210ENST00000491036 MT1MQ8N339 61 aa5.74□□□□□ -1.49
LAMA5-210ENST00000491036 LCE4AQ5TA78 99 aa5.71□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 MT1LQ93083 61 aa5.71□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.71□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 MT4P47944 62 aa5.7□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 LCE3AQ5TA76 89 aa5.67□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 TNP1P09430 55 aa5.65□□□□□ -1.5
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.63□□□□□ -1.51
LAMA5-210ENST00000491036 A6NED7 52 aa5.59□□□□□ -1.51
LAMA5-210ENST00000491036 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.58□□□□□ -1.52
LAMA5-210ENST00000491036 K7ERS5 55 aa5.55□□□□□ -1.52
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.54□□□□□ -1.52
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.5□□□□□ -1.53
LAMA5-210ENST00000491036 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.48□□□□□ -1.53
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.46□□□□□ -1.54
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP12-3P60328 96 aa5.44□□□□□ -1.54
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.41□□□□□ -1.54
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.41□□□□□ -1.54
LAMA5-210ENST00000491036 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.39□□□□□ -1.55
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.26□□□□□ -1.57
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.26□□□□□ -1.57
LAMA5-210ENST00000491036 ROMO1P60602 79 aa5.25□□□□□ -1.57
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.22□□□□□ -1.57
LAMA5-210ENST00000491036 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.21□□□□□ -1.58
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP12-4P60329 112 aa5.2□□□□□ -1.58
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.19□□□□□ -1.58
LAMA5-210ENST00000491036 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.18□□□□□ -1.58
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.09□□□□□ -1.59
LAMA5-210ENST00000491036 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
LAMA5-210ENST00000491036 BRK1Q8WUW1 75 aa5.08□□□□□ -1.6
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.04□□□□□ -1.6
LAMA5-210ENST00000491036 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.99□□□□□ -1.61
LAMA5-210ENST00000491036 MT1AP04731 61 aa4.86□□□□□ -1.63
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.86□□□□□ -1.63
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.85□□□□□ -1.63
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.83□□□□□ -1.64
LAMA5-210ENST00000491036 PMAIP1Q13794 54 aa4.76□□□□□ -1.65
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.73□□□□□ -1.65
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-8O75690 187 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA5-210ENST00000491036 PRAC1Q96KF2 57 aa4.6□□□□□ -1.67
LAMA5-210ENST00000491036 PRO0628Q9UI54 55 aa4.6□□□□□ -1.67
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.5□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.49□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 MUC5ACP98088 5654 aa4.48□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 MT3P25713 68 aa4.47□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
LAMA5-210ENST00000491036 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.37□□□□□ -1.71
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.36□□□□□ -1.71
LAMA5-210ENST00000491036 SVIPQ8NHG7 77 aa4.18□□□□□ -1.74
LAMA5-210ENST00000491036 LCE1EQ5T753 118 aa4.12□□□□□ -1.75
LAMA5-210ENST00000491036 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.95□□□□□ -1.78
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.91□□□□□ -1.78
LAMA5-210ENST00000491036 LCE1CQ5T751 118 aa3.82□□□□□ -1.8
LAMA5-210ENST00000491036 LUZP6Q538Z0 58 aa3.76□□□□□ -1.81
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.65□□□□□ -1.83
LAMA5-210ENST00000491036 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.58□□□□□ -1.84
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.47□□□□□ -1.85
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LAMA5-210ENST00000491036 LCE1FQ5T754 118 aa3.42□□□□□ -1.86
LAMA5-210ENST00000491036 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.41□□□□□ -1.86
LAMA5-210ENST00000491036 NDUFAF8A1L188 74 aa3.28□□□□□ -1.88
LAMA5-210ENST00000491036 PHGR1C9JFL3 82 aa3.19□□□□□ -1.9
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.19□□□□□ -1.9
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.99□□□□□ -1.93
LAMA5-210ENST00000491036 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.79□□□□□ -1.96
LAMA5-210ENST00000491036 PRM1P04553 51 aa2.73□□□□□ -1.97
LAMA5-210ENST00000491036 A0A0A0MQY5 61 aa2.65□□□□□ -1.99
LAMA5-210ENST00000491036 INE1O15225 51 aa2.62□□□□□ -1.99
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.41□□□□□ -2.02
LAMA5-210ENST00000491036 H3BS24 57 aa2.06□□□□□ -2.08
LAMA5-210ENST00000491036 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.03□□□□□ -2.08
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