RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.52□□□□□ -1.69
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.51□□□□□ -1.69
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.44□□□□□ -1.7
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.43□□□□□ -1.7
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP12-4P60329 112 aa4.42□□□□□ -1.7
NISCH-212ENST00000488380 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.4□□□□□ -1.7
NISCH-212ENST00000488380 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.38□□□□□ -1.71
NISCH-212ENST00000488380 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
NISCH-212ENST00000488380 MT1GP13640 62 aa4.32□□□□□ -1.72
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.32□□□□□ -1.72
NISCH-212ENST00000488380 MT1MQ8N339 61 aa4.28□□□□□ -1.72
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.27□□□□□ -1.73
NISCH-212ENST00000488380 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.19□□□□□ -1.74
NISCH-212ENST00000488380 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
NISCH-212ENST00000488380 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.14□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 MDN1Q9NU22 5596 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 LCE3BQ5TA77 95 aa4.12□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.11□□□□□ -1.75
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-9P26371 169 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
NISCH-212ENST00000488380 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.96□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 PRM1P04553 51 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.93□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-212ENST00000488380 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.9□□□□□ -1.79
NISCH-212ENST00000488380 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.89□□□□□ -1.79
NISCH-212ENST00000488380 MT1AP04731 61 aa3.85□□□□□ -1.79
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2EP22531 72 aa3.81□□□□□ -1.8
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2BP35325 72 aa3.81□□□□□ -1.8
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2AP35326 72 aa3.81□□□□□ -1.8
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.67□□□□□ -1.82
NISCH-212ENST00000488380 NEBP20929 6669 aa3.64□□□□□ -1.83
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2DP22532 72 aa3.63□□□□□ -1.83
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.59□□□□□ -1.84
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.48□□□□□ -1.85
NISCH-212ENST00000488380 LCE1EQ5T753 118 aa3.42□□□□□ -1.86
NISCH-212ENST00000488380 MT3P25713 68 aa3.4□□□□□ -1.87
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.35□□□□□ -1.87
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.33□□□□□ -1.88
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.3□□□□□ -1.88
NISCH-212ENST00000488380 MT4P47944 62 aa3.27□□□□□ -1.89
NISCH-212ENST00000488380 LCE1DQ5T752 114 aa3.24□□□□□ -1.89
NISCH-212ENST00000488380 LCE4AQ5TA78 99 aa3.24□□□□□ -1.89
NISCH-212ENST00000488380 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.16□□□□□ -1.9
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.15□□□□□ -1.9
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.09□□□□□ -1.92
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.99□□□□□ -1.93
NISCH-212ENST00000488380 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.99□□□□□ -1.93
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.98□□□□□ -1.93
NISCH-212ENST00000488380 MUC5ACP98088 5654 aa2.98□□□□□ -1.93
NISCH-212ENST00000488380 LCE1FQ5T754 118 aa2.88□□□□□ -1.95
NISCH-212ENST00000488380 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.84□□□□□ -1.95
NISCH-212ENST00000488380 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.77□□□□□ -1.97
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.74□□□□□ -1.97
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.69□□□□□ -1.98
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.67□□□□□ -1.98
NISCH-212ENST00000488380 LCE1CQ5T751 118 aa2.62□□□□□ -1.99
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.61□□□□□ -1.99
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-8O75690 187 aa2.59□□□□□ -2
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.51□□□□□ -2.01
NISCH-212ENST00000488380 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.47□□□□□ -2.01
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.4□□□□□ -2.03
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.4□□□□□ -2.03
NISCH-212ENST00000488380 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.27□□□□□ -2.05
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.27□□□□□ -2.05
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.25□□□□□ -2.05
NISCH-212ENST00000488380 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
NISCH-212ENST00000488380 PHGR1C9JFL3 82 aa1.97□□□□□ -2.09
NISCH-212ENST00000488380 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
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