RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 PSPHP1O15172 72 aa5.93□□□□□ -1.46
ATG4B-216ENST00000475195 MT1LQ93083 61 aa5.88□□□□□ -1.47
ATG4B-216ENST00000475195 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ATG4B-216ENST00000475195 PP632Q6XCG6 107 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4B-216ENST00000475195 K7ERS5 55 aa5.83□□□□□ -1.48
ATG4B-216ENST00000475195 PCP4P48539 62 aa5.82□□□□□ -1.48
ATG4B-216ENST00000475195 MT1MQ8N339 61 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP12-3P60328 96 aa5.75□□□□□ -1.49
ATG4B-216ENST00000475195 A6NED7 52 aa5.73□□□□□ -1.49
ATG4B-216ENST00000475195 H3BS24 57 aa5.69□□□□□ -1.5
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4B-216ENST00000475195 LCE4AQ5TA78 99 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4B-216ENST00000475195 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4B-216ENST00000475195 ROMO1P60602 79 aa5.49□□□□□ -1.53
ATG4B-216ENST00000475195 LCE1DQ5T752 114 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.44□□□□□ -1.54
ATG4B-216ENST00000475195 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.42□□□□□ -1.54
ATG4B-216ENST00000475195 MT4P47944 62 aa5.4□□□□□ -1.54
ATG4B-216ENST00000475195 A0A0A0MQY5 61 aa5.38□□□□□ -1.55
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
ATG4B-216ENST00000475195 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.34□□□□□ -1.55
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.32□□□□□ -1.56
ATG4B-216ENST00000475195 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.27□□□□□ -1.57
ATG4B-216ENST00000475195 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.24□□□□□ -1.57
ATG4B-216ENST00000475195 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.17□□□□□ -1.58
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.15□□□□□ -1.59
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP12-4P60329 112 aa5.14□□□□□ -1.59
ATG4B-216ENST00000475195 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4B-216ENST00000475195 BRK1Q8WUW1 75 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4B-216ENST00000475195 MT1AP04731 61 aa5□□□□□ -1.61
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.95□□□□□ -1.62
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.85□□□□□ -1.63
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.84□□□□□ -1.63
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.83□□□□□ -1.64
ATG4B-216ENST00000475195 PMAIP1Q13794 54 aa4.77□□□□□ -1.65
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.67□□□□□ -1.66
ATG4B-216ENST00000475195 MT3P25713 68 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG4B-216ENST00000475195 PRO0628Q9UI54 55 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG4B-216ENST00000475195 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.54□□□□□ -1.68
ATG4B-216ENST00000475195 PRAC1Q96KF2 57 aa4.53□□□□□ -1.68
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-8O75690 187 aa4.52□□□□□ -1.69
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.32□□□□□ -1.72
ATG4B-216ENST00000475195 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.28□□□□□ -1.72
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ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.22□□□□□ -1.73
ATG4B-216ENST00000475195 LCE1EQ5T753 118 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4B-216ENST00000475195 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
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ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.93□□□□□ -1.78
ATG4B-216ENST00000475195 LCE1CQ5T751 118 aa3.9□□□□□ -1.79
ATG4B-216ENST00000475195 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.9□□□□□ -1.79
ATG4B-216ENST00000475195 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.87□□□□□ -1.79
ATG4B-216ENST00000475195 NDUFAF8A1L188 74 aa3.83□□□□□ -1.8
ATG4B-216ENST00000475195 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.66□□□□□ -1.82
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.5□□□□□ -1.85
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.45□□□□□ -1.86
ATG4B-216ENST00000475195 LCE1FQ5T754 118 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG4B-216ENST00000475195 PHGR1C9JFL3 82 aa3.02□□□□□ -1.93
ATG4B-216ENST00000475195 INE1O15225 51 aa2.93□□□□□ -1.94
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.92□□□□□ -1.94
ATG4B-216ENST00000475195 PRM1P04553 51 aa2.79□□□□□ -1.96
ATG4B-216ENST00000475195 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.74□□□□□ -1.97
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.21□□□□□ -2.06
ATG4B-216ENST00000475195 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.91□□□□□ -2.1
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