RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A0A1B0GU33 70 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSPHP1O15172 72 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.93□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UQCR11O14957 56 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.9□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A8MU10 97 aa2.89□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A0A0D9SG42 100 aa2.87□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A6NED7 52 aa2.87□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP12-1P59990 96 aa2.87□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.87□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT1EP04732 61 aa2.86□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.85□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRAC1Q96KF2 57 aa2.84□□□□□ -1.95
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.83□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.83□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.81□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.77□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BRK1Q8WUW1 75 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT1GP13640 62 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 K7ERS5 55 aa2.73□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.73□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT4P47944 62 aa2.72□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT1MQ8N339 61 aa2.72□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT1LQ93083 61 aa2.72□□□□□ -1.97
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.71□□□□□ -1.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRO0628Q9UI54 55 aa2.71□□□□□ -1.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE3AQ5TA76 89 aa2.69□□□□□ -1.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PP632Q6XCG6 107 aa2.66□□□□□ -1.98
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.64□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.64□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ROMO1P60602 79 aa2.63□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNP1P09430 55 aa2.62□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.62□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.59□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PMAIP1Q13794 54 aa2.57□□□□□ -2
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP12-3P60328 96 aa2.55□□□□□ -2
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.53□□□□□ -2
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.5□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.49□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NDUFAF8A1L188 74 aa2.47□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.47□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.43□□□□□ -2.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP12-4P60329 112 aa2.41□□□□□ -2.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.35□□□□□ -2.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.33□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LUZP6Q538Z0 58 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT1AP04731 61 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-8O75690 187 aa2.24□□□□□ -2.05
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.23□□□□□ -2.05
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.18□□□□□ -2.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.15□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MT3P25713 68 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUC5ACP98088 5654 aa2.11□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.1□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE1FQ5T754 118 aa2.09□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE1EQ5T753 118 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.87□□□□□ -2.11
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.85□□□□□ -2.11
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE1CQ5T751 118 aa1.79□□□□□ -2.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.77□□□□□ -2.13
TTC28-AS1-220ENST00000454996 INE1O15225 51 aa1.74□□□□□ -2.13
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.67□□□□□ -2.14
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.54□□□□□ -2.16
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHGR1C9JFL3 82 aa1.5□□□□□ -2.17
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRM1P04553 51 aa1.37□□□□□ -2.19
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.3□□□□□ -2.2
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.1□□□□□ -2.23
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 603.4 ms