RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAC1Q96KF2 57 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GU33 70 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GU69 56 aa3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM258P61165 79 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1GP13640 62 aa3.72□□□□□ -1.81
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR15LQ9BU68 103 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP12-1P59990 96 aa3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 PP632Q6XCG6 107 aa3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1MQ8N339 61 aa3.68□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MT3P25713 68 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MT4P47944 62 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1LQ93083 61 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MU10 97 aa3.61□□□□□ -1.83
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE3AQ5TA76 89 aa3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4-206ENST00000446904 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCR11O14957 56 aa3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4-206ENST00000446904 TNP1P09430 55 aa3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4-206ENST00000446904 V9GYY9 64 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4-206ENST00000446904 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4-206ENST00000446904 Q1T7F1 81 aa3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP12-3P60328 96 aa3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4-206ENST00000446904 K7ERS5 55 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4-206ENST00000446904 PSPHP1O15172 72 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFAF8A1L188 74 aa3.43□□□□□ -1.86
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 A6NED7 52 aa3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.34□□□□□ -1.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP12-4P60329 112 aa3.32□□□□□ -1.88
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE1FQ5T754 118 aa3.29□□□□□ -1.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE1EQ5T753 118 aa3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4-206ENST00000446904 ROMO1P60602 79 aa3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4-206ENST00000446904 PRO0628Q9UI54 55 aa3.17□□□□□ -1.9
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.16□□□□□ -1.9
SH3BP4-206ENST00000446904 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.11□□□□□ -1.91
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1AP04731 61 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-8O75690 187 aa3.02□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 LUZP6Q538Z0 58 aa2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 BRK1Q8WUW1 75 aa2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PMAIP1Q13794 54 aa2.92□□□□□ -1.94
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.61□□□□□ -1.99
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.53□□□□□ -2
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE1CQ5T751 118 aa2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.44□□□□□ -2.02
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4-206ENST00000446904 PHGR1C9JFL3 82 aa2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4-206ENST00000446904 INE1O15225 51 aa1.97□□□□□ -2.09
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.88□□□□□ -2.11
SH3BP4-206ENST00000446904 PRM1P04553 51 aa1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.28□□□□□ -2.21
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