RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

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Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 PSPHP1O15172 72 aa6.96□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.96□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 LCE3AQ5TA76 89 aa6.95□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 MT1MQ8N339 61 aa6.95□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 MT1LQ93083 61 aa6.95□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.91□□□□□ -1.3
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1DQ5T752 114 aa6.88□□□□□ -1.31
NPAS1-201ENST00000439365 MT4P47944 62 aa6.84□□□□□ -1.31
NPAS1-201ENST00000439365 LCE4AQ5TA78 99 aa6.83□□□□□ -1.32
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.81□□□□□ -1.32
NPAS1-201ENST00000439365 A6NED7 52 aa6.78□□□□□ -1.32
NPAS1-201ENST00000439365 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.77□□□□□ -1.33
NPAS1-201ENST00000439365 K7ERS5 55 aa6.71□□□□□ -1.34
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP12-3P60328 96 aa6.68□□□□□ -1.34
NPAS1-201ENST00000439365 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.65□□□□□ -1.35
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.64□□□□□ -1.35
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.63□□□□□ -1.35
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.63□□□□□ -1.35
NPAS1-201ENST00000439365 BRK1Q8WUW1 75 aa6.62□□□□□ -1.35
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.58□□□□□ -1.36
NPAS1-201ENST00000439365 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.54□□□□□ -1.36
NPAS1-201ENST00000439365 PRO0628Q9UI54 55 aa6.43□□□□□ -1.38
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.41□□□□□ -1.38
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.38□□□□□ -1.39
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NPAS1-201ENST00000439365 ROMO1P60602 79 aa6.32□□□□□ -1.4
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.32□□□□□ -1.4
NPAS1-201ENST00000439365 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.29□□□□□ -1.4
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP12-4P60329 112 aa6.28□□□□□ -1.4
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.25□□□□□ -1.41
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.25□□□□□ -1.41
NPAS1-201ENST00000439365 PMAIP1Q13794 54 aa6.25□□□□□ -1.41
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.25□□□□□ -1.41
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.23□□□□□ -1.41
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.17□□□□□ -1.42
NPAS1-201ENST00000439365 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.13□□□□□ -1.43
NPAS1-201ENST00000439365 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
NPAS1-201ENST00000439365 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.99□□□□□ -1.45
NPAS1-201ENST00000439365 MT1AP04731 61 aa5.9□□□□□ -1.47
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.89□□□□□ -1.47
NPAS1-201ENST00000439365 PRAC1Q96KF2 57 aa5.85□□□□□ -1.47
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.81□□□□□ -1.48
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.8□□□□□ -1.48
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.79□□□□□ -1.48
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.73□□□□□ -1.49
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.67□□□□□ -1.5
NPAS1-201ENST00000439365 SVIPQ8NHG7 77 aa5.66□□□□□ -1.5
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-8O75690 187 aa5.59□□□□□ -1.51
NPAS1-201ENST00000439365 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.56□□□□□ -1.52
NPAS1-201ENST00000439365 MT3P25713 68 aa5.44□□□□□ -1.54
NPAS1-201ENST00000439365 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
NPAS1-201ENST00000439365 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
NPAS1-201ENST00000439365 MUC5ACP98088 5654 aa5.39□□□□□ -1.55
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.37□□□□□ -1.55
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.23□□□□□ -1.57
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1EQ5T753 118 aa4.97□□□□□ -1.61
NPAS1-201ENST00000439365 LUZP6Q538Z0 58 aa4.83□□□□□ -1.64
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.78□□□□□ -1.64
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.7□□□□□ -1.66
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1CQ5T751 118 aa4.62□□□□□ -1.67
NPAS1-201ENST00000439365 NDUFAF8A1L188 74 aa4.61□□□□□ -1.67
NPAS1-201ENST00000439365 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.44□□□□□ -1.7
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.38□□□□□ -1.71
NPAS1-201ENST00000439365 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.2□□□□□ -1.74
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.19□□□□□ -1.74
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1FQ5T754 118 aa4.1□□□□□ -1.75
NPAS1-201ENST00000439365 A0A0A0MQY5 61 aa4.07□□□□□ -1.76
NPAS1-201ENST00000439365 H3BS24 57 aa3.95□□□□□ -1.78
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.85□□□□□ -1.79
NPAS1-201ENST00000439365 INE1O15225 51 aa3.83□□□□□ -1.8
NPAS1-201ENST00000439365 PHGR1C9JFL3 82 aa3.79□□□□□ -1.8
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.62□□□□□ -1.83
NPAS1-201ENST00000439365 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.42□□□□□ -1.86
NPAS1-201ENST00000439365 PRM1P04553 51 aa3.25□□□□□ -1.89
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.86□□□□□ -1.95
NPAS1-201ENST00000439365 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.37□□□□□ -2.03
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