RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.81□□□□□ -1.64
PRAME-208ENST00000438888 PMAIP1Q13794 54 aa4.8□□□□□ -1.64
PRAME-208ENST00000438888 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.77□□□□□ -1.65
PRAME-208ENST00000438888 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PRAME-208ENST00000438888 LCE3AQ5TA76 89 aa4.69□□□□□ -1.66
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.68□□□□□ -1.66
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.65□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.62□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 MT1EP04732 61 aa4.6□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 PP632Q6XCG6 107 aa4.6□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.6□□□□□ -1.67
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.57□□□□□ -1.68
PRAME-208ENST00000438888 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.54□□□□□ -1.68
PRAME-208ENST00000438888 LCE1DQ5T752 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP12-3P60328 96 aa4.51□□□□□ -1.69
PRAME-208ENST00000438888 PRAC1Q96KF2 57 aa4.51□□□□□ -1.69
PRAME-208ENST00000438888 MT4P47944 62 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-208ENST00000438888 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.44□□□□□ -1.7
PRAME-208ENST00000438888 MT1GP13640 62 aa4.44□□□□□ -1.7
PRAME-208ENST00000438888 LCE4AQ5TA78 99 aa4.41□□□□□ -1.7
PRAME-208ENST00000438888 MT1MQ8N339 61 aa4.4□□□□□ -1.71
PRAME-208ENST00000438888 MT1LQ93083 61 aa4.38□□□□□ -1.71
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.37□□□□□ -1.71
PRAME-208ENST00000438888 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.37□□□□□ -1.71
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.34□□□□□ -1.71
PRAME-208ENST00000438888 SVIPQ8NHG7 77 aa4.3□□□□□ -1.72
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.29□□□□□ -1.72
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.29□□□□□ -1.72
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.27□□□□□ -1.73
PRAME-208ENST00000438888 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.2□□□□□ -1.74
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.18□□□□□ -1.74
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.15□□□□□ -1.75
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.13□□□□□ -1.75
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.09□□□□□ -1.75
PRAME-208ENST00000438888 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.03□□□□□ -1.76
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP12-4P60329 112 aa3.99□□□□□ -1.77
PRAME-208ENST00000438888 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PRAME-208ENST00000438888 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.97□□□□□ -1.77
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.94□□□□□ -1.78
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.78□□□□□ -1.8
PRAME-208ENST00000438888 LUZP6Q538Z0 58 aa3.75□□□□□ -1.81
PRAME-208ENST00000438888 MT1AP04731 61 aa3.73□□□□□ -1.81
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.71□□□□□ -1.82
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.7□□□□□ -1.82
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-8O75690 187 aa3.65□□□□□ -1.83
PRAME-208ENST00000438888 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PRAME-208ENST00000438888 MUC5ACP98088 5654 aa3.65□□□□□ -1.83
PRAME-208ENST00000438888 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.59□□□□□ -1.83
PRAME-208ENST00000438888 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.58□□□□□ -1.84
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.58□□□□□ -1.84
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.52□□□□□ -1.85
PRAME-208ENST00000438888 NDUFAF8A1L188 74 aa3.47□□□□□ -1.85
PRAME-208ENST00000438888 MT3P25713 68 aa3.39□□□□□ -1.87
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.38□□□□□ -1.87
PRAME-208ENST00000438888 LCE1EQ5T753 118 aa3.12□□□□□ -1.91
PRAME-208ENST00000438888 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.11□□□□□ -1.91
PRAME-208ENST00000438888 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.06□□□□□ -1.92
PRAME-208ENST00000438888 A0A0A0MQY5 61 aa3.01□□□□□ -1.93
PRAME-208ENST00000438888 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.01□□□□□ -1.93
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.01□□□□□ -1.93
PRAME-208ENST00000438888 LCE1CQ5T751 118 aa2.91□□□□□ -1.94
PRAME-208ENST00000438888 INE1O15225 51 aa2.87□□□□□ -1.95
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.87□□□□□ -1.95
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.66□□□□□ -1.98
PRAME-208ENST00000438888 H3BS24 57 aa2.63□□□□□ -1.99
PRAME-208ENST00000438888 LCE1FQ5T754 118 aa2.61□□□□□ -1.99
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PRAME-208ENST00000438888 PHGR1C9JFL3 82 aa2.54□□□□□ -2
PRAME-208ENST00000438888 PRM1P04553 51 aa2.52□□□□□ -2.01
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.42□□□□□ -2.02
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.32□□□□□ -2.04
PRAME-208ENST00000438888 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.24□□□□□ -2.05
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.9□□□□□ -2.11
PRAME-208ENST00000438888 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.58□□□□□ -2.16
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