RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.97□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.93□□□□□ -1.46
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-9P26371 169 aa5.82□□□□□ -1.48
CNGA3-205ENST00000436404 MT1EP04732 61 aa5.82□□□□□ -1.48
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.8□□□□□ -1.48
CNGA3-205ENST00000436404 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.77□□□□□ -1.48
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.77□□□□□ -1.49
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.69□□□□□ -1.5
CNGA3-205ENST00000436404 MT1LQ93083 61 aa5.67□□□□□ -1.5
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.67□□□□□ -1.5
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.66□□□□□ -1.5
CNGA3-205ENST00000436404 MDN1Q9NU22 5596 aa5.63□□□□□ -1.51
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.6□□□□□ -1.51
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.59□□□□□ -1.51
CNGA3-205ENST00000436404 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.55□□□□□ -1.52
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2EP22531 72 aa5.53□□□□□ -1.52
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2BP35325 72 aa5.53□□□□□ -1.52
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2AP35326 72 aa5.53□□□□□ -1.52
CNGA3-205ENST00000436404 MT1GP13640 62 aa5.52□□□□□ -1.53
CNGA3-205ENST00000436404 MT1MQ8N339 61 aa5.48□□□□□ -1.53
CNGA3-205ENST00000436404 NEBP20929 6669 aa5.44□□□□□ -1.54
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP12-4P60329 112 aa5.43□□□□□ -1.54
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.4□□□□□ -1.54
CNGA3-205ENST00000436404 SPRR2DP22532 72 aa5.34□□□□□ -1.56
CNGA3-205ENST00000436404 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CNGA3-205ENST00000436404 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.25□□□□□ -1.57
CNGA3-205ENST00000436404 LCE3BQ5TA77 95 aa5.15□□□□□ -1.59
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.01□□□□□ -1.61
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNGA3-205ENST00000436404 MT1AP04731 61 aa4.94□□□□□ -1.62
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.94□□□□□ -1.62
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.91□□□□□ -1.62
CNGA3-205ENST00000436404 PRM1P04553 51 aa4.87□□□□□ -1.63
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.84□□□□□ -1.64
CNGA3-205ENST00000436404 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.84□□□□□ -1.64
CNGA3-205ENST00000436404 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.83□□□□□ -1.64
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.79□□□□□ -1.64
CNGA3-205ENST00000436404 LCE4AQ5TA78 99 aa4.73□□□□□ -1.65
CNGA3-205ENST00000436404 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNGA3-205ENST00000436404 MT4P47944 62 aa4.65□□□□□ -1.66
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.64□□□□□ -1.67
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1DQ5T752 114 aa4.62□□□□□ -1.67
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.58□□□□□ -1.68
CNGA3-205ENST00000436404 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.55□□□□□ -1.68
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.54□□□□□ -1.68
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.51□□□□□ -1.69
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.38□□□□□ -1.71
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.36□□□□□ -1.71
CNGA3-205ENST00000436404 MT3P25713 68 aa4.33□□□□□ -1.72
CNGA3-205ENST00000436404 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.1□□□□□ -1.75
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1EQ5T753 118 aa4.09□□□□□ -1.75
CNGA3-205ENST00000436404 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.06□□□□□ -1.76
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.94□□□□□ -1.78
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.94□□□□□ -1.78
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-8O75690 187 aa3.83□□□□□ -1.8
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.8□□□□□ -1.8
CNGA3-205ENST00000436404 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.8□□□□□ -1.8
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.67□□□□□ -1.82
CNGA3-205ENST00000436404 MUC5ACP98088 5654 aa3.63□□□□□ -1.83
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.61□□□□□ -1.83
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.58□□□□□ -1.84
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1CQ5T751 118 aa3.56□□□□□ -1.84
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.42□□□□□ -1.86
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CNGA3-205ENST00000436404 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CNGA3-205ENST00000436404 LCE1FQ5T754 118 aa3.24□□□□□ -1.89
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.17□□□□□ -1.9
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.16□□□□□ -1.9
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.15□□□□□ -1.91
CNGA3-205ENST00000436404 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.03□□□□□ -1.92
CNGA3-205ENST00000436404 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.8□□□□□ -1.96
CNGA3-205ENST00000436404 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.8□□□□□ -1.96
CNGA3-205ENST00000436404 PHGR1C9JFL3 82 aa2.73□□□□□ -1.97
CNGA3-205ENST00000436404 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.7 ms