RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 COL7A1Q02388 2944 aa0.92□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.91□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 HSPG2P98160 4391 aa0.91□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 TNXBP22105 4242 aa0.91□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.9□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.9□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 HIVEP1P15822 2718 aa0.9□□□□□ -2.26
PTPRC-205ENST00000391970 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.9□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.9□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 ROS1P08922 2347 aa0.9□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 SPINK1P00995 79 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 CENPEQ02224 2701 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 TGP01266 2768 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 SMR3AQ99954 134 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 PKHD1P08F94 4074 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.87□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 APLNQ9ULZ1 77 aa0.87□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 ACANP16112 2415 aa0.87□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.87□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 ITPR2Q14571 2701 aa0.87□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0D9SG42 100 aa0.85□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.85□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.85□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.84□□□□□ -2.27
PTPRC-205ENST00000391970 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf92A6NGG3 77 aa0.83□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 DEFB135Q30KP9 77 aa0.83□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 LPAP08519 4548 aa0.83□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 FAT1Q14517 4588 aa0.82□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 TNP1P09430 55 aa0.81□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.81□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.8□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.8□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 DEFB4AO15263 64 aa0.78□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 HTN3P15516 51 aa0.78□□□□□ -2.28
PTPRC-205ENST00000391970 USH2AO75445 5202 aa0.77□□□□□ -2.29
PTPRC-205ENST00000391970 MUC17Q685J3 4493 aa0.76□□□□□ -2.29
PTPRC-205ENST00000391970 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.75□□□□□ -2.29
PTPRC-205ENST00000391970 LRP2P98164 4655 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.69□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 M0R2T5 61 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRC-205ENST00000391970 MT1AP04731 61 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRC-205ENST00000391970 PRM1P04553 51 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-205ENST00000391970 MT1EP04732 61 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-205ENST00000391970 MT1XP80297 61 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 PHGR1C9JFL3 82 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2BP35325 72 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2AP35326 72 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 MT1LQ93083 61 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 MT1BP07438 61 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2DP22532 72 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-205ENST00000391970 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 MT1HL1P0DM35 61 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 SPRR2EP22531 72 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.52□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 MT1HP80294 61 aa0.51□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.5□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.49□□□□□ -2.33
PTPRC-205ENST00000391970 MT2AP02795 61 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-205ENST00000391970 MT1FP04733 61 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-205ENST00000391970 MT1GP13640 62 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-205ENST00000391970 MT1MQ8N339 61 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-205ENST00000391970 MT4P47944 62 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.22□□□□□ -2.37
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