RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.26□□□□□ -1.41
CITED2-201ENST00000367651 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.21□□□□□ -1.42
CITED2-201ENST00000367651 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.1□□□□□ -1.43
CITED2-201ENST00000367651 MT1GP13640 62 aa6.09□□□□□ -1.43
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.02□□□□□ -1.45
CITED2-201ENST00000367651 MT1MQ8N339 61 aa6.01□□□□□ -1.45
CITED2-201ENST00000367651 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.97□□□□□ -1.45
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CITED2-201ENST00000367651 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP12-4P60329 112 aa5.78□□□□□ -1.48
CITED2-201ENST00000367651 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.74□□□□□ -1.49
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.72□□□□□ -1.49
CITED2-201ENST00000367651 LCE3BQ5TA77 95 aa5.67□□□□□ -1.5
CITED2-201ENST00000367651 MDN1Q9NU22 5596 aa5.65□□□□□ -1.5
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.64□□□□□ -1.51
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CITED2-201ENST00000367651 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CITED2-201ENST00000367651 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.48□□□□□ -1.53
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CITED2-201ENST00000367651 SPRR2EP22531 72 aa5.4□□□□□ -1.54
CITED2-201ENST00000367651 SPRR2BP35325 72 aa5.4□□□□□ -1.54
CITED2-201ENST00000367651 SPRR2AP35326 72 aa5.4□□□□□ -1.54
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.37□□□□□ -1.55
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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CITED2-201ENST00000367651 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.91□□□□□ -1.62
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.81□□□□□ -1.64
CITED2-201ENST00000367651 MT3P25713 68 aa4.79□□□□□ -1.64
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.79□□□□□ -1.64
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.69□□□□□ -1.66
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.6□□□□□ -1.67
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.58□□□□□ -1.68
CITED2-201ENST00000367651 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.45□□□□□ -1.7
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.37□□□□□ -1.71
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.3□□□□□ -1.72
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CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.11□□□□□ -1.75
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CITED2-201ENST00000367651 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.99□□□□□ -1.77
CITED2-201ENST00000367651 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.92□□□□□ -1.78
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.91□□□□□ -1.78
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.83□□□□□ -1.8
CITED2-201ENST00000367651 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.71□□□□□ -1.82
CITED2-201ENST00000367651 LCE1CQ5T751 118 aa3.66□□□□□ -1.82
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-8O75690 187 aa3.62□□□□□ -1.83
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.55□□□□□ -1.84
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.47□□□□□ -1.85
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.31□□□□□ -1.88
CITED2-201ENST00000367651 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.24□□□□□ -1.89
CITED2-201ENST00000367651 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CITED2-201ENST00000367651 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.18□□□□□ -1.9
CITED2-201ENST00000367651 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.14□□□□□ -1.91
CITED2-201ENST00000367651 PHGR1C9JFL3 82 aa2.73□□□□□ -1.97
CITED2-201ENST00000367651 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms