RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 MT1GP13640 62 aa6.8□□□□□ -1.32
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.8□□□□□ -1.32
OPN3-201ENST00000366554 SSPOA2VEC9 5147 aa6.76□□□□□ -1.33
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.74□□□□□ -1.33
OPN3-201ENST00000366554 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
OPN3-201ENST00000366554 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.6□□□□□ -1.35
OPN3-201ENST00000366554 MT1MQ8N339 61 aa6.58□□□□□ -1.36
OPN3-201ENST00000366554 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.48□□□□□ -1.37
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.46□□□□□ -1.37
OPN3-201ENST00000366554 LCE3BQ5TA77 95 aa6.46□□□□□ -1.38
OPN3-201ENST00000366554 MT1AP04731 61 aa6.44□□□□□ -1.38
OPN3-201ENST00000366554 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.42□□□□□ -1.38
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.36□□□□□ -1.39
OPN3-201ENST00000366554 PRM1P04553 51 aa6.35□□□□□ -1.39
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
OPN3-201ENST00000366554 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.31□□□□□ -1.4
OPN3-201ENST00000366554 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.3□□□□□ -1.4
OPN3-201ENST00000366554 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
OPN3-201ENST00000366554 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.29□□□□□ -1.4
OPN3-201ENST00000366554 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.26□□□□□ -1.41
OPN3-201ENST00000366554 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
OPN3-201ENST00000366554 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.17□□□□□ -1.42
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.14□□□□□ -1.43
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.1□□□□□ -1.43
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.95□□□□□ -1.46
OPN3-201ENST00000366554 MDN1Q9NU22 5596 aa5.88□□□□□ -1.47
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.86□□□□□ -1.47
OPN3-201ENST00000366554 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.85□□□□□ -1.47
OPN3-201ENST00000366554 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.83□□□□□ -1.48
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.61□□□□□ -1.51
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-9P26371 169 aa5.58□□□□□ -1.52
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OPN3-201ENST00000366554 SPRR2EP22531 72 aa5.48□□□□□ -1.53
OPN3-201ENST00000366554 SPRR2BP35325 72 aa5.48□□□□□ -1.53
OPN3-201ENST00000366554 SPRR2AP35326 72 aa5.48□□□□□ -1.53
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OPN3-201ENST00000366554 LCE1EQ5T753 118 aa5.32□□□□□ -1.56
OPN3-201ENST00000366554 SPRR2DP22532 72 aa5.26□□□□□ -1.57
OPN3-201ENST00000366554 LCE1DQ5T752 114 aa5.15□□□□□ -1.59
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.99□□□□□ -1.61
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.72□□□□□ -1.65
OPN3-201ENST00000366554 MT4P47944 62 aa4.72□□□□□ -1.65
OPN3-201ENST00000366554 MUC5ACP98088 5654 aa4.7□□□□□ -1.66
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.67□□□□□ -1.66
OPN3-201ENST00000366554 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.66□□□□□ -1.66
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.64□□□□□ -1.67
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.56□□□□□ -1.68
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.5□□□□□ -1.69
OPN3-201ENST00000366554 LCE4AQ5TA78 99 aa4.49□□□□□ -1.69
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.39□□□□□ -1.71
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.38□□□□□ -1.71
OPN3-201ENST00000366554 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.21□□□□□ -1.74
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.2□□□□□ -1.74
OPN3-201ENST00000366554 LCE1FQ5T754 118 aa4.17□□□□□ -1.74
OPN3-201ENST00000366554 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.14□□□□□ -1.75
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.1□□□□□ -1.75
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.01□□□□□ -1.77
OPN3-201ENST00000366554 LCE1CQ5T751 118 aa3.98□□□□□ -1.77
OPN3-201ENST00000366554 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.96□□□□□ -1.78
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.95□□□□□ -1.78
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
OPN3-201ENST00000366554 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.81□□□□□ -1.8
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-8O75690 187 aa3.73□□□□□ -1.81
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.6□□□□□ -1.83
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.56□□□□□ -1.84
OPN3-201ENST00000366554 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.39□□□□□ -1.87
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.33□□□□□ -1.88
OPN3-201ENST00000366554 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.25□□□□□ -1.89
OPN3-201ENST00000366554 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
OPN3-201ENST00000366554 PHGR1C9JFL3 82 aa2.89□□□□□ -1.95
OPN3-201ENST00000366554 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
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