RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-201ENST00000345716 MT1MQ8N339 61 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-201ENST00000345716 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.57□□□□□ -1.36
NISCH-201ENST00000345716 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.52□□□□□ -1.37
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.51□□□□□ -1.37
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.48□□□□□ -1.37
NISCH-201ENST00000345716 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.48□□□□□ -1.37
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.44□□□□□ -1.38
NISCH-201ENST00000345716 MUC2Q02817 5179 aa6.42□□□□□ -1.38
NISCH-201ENST00000345716 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
NISCH-201ENST00000345716 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NISCH-201ENST00000345716 MT3P25713 68 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-201ENST00000345716 MT4P47944 62 aa6.13□□□□□ -1.43
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
NISCH-201ENST00000345716 MT1AP04731 61 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.03□□□□□ -1.44
NISCH-201ENST00000345716 PRM1P04553 51 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.96□□□□□ -1.46
NISCH-201ENST00000345716 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
NISCH-201ENST00000345716 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-201ENST00000345716 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-201ENST00000345716 USH2AO75445 5202 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-201ENST00000345716 LCE1DQ5T752 114 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-201ENST00000345716 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-201ENST00000345716 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.76□□□□□ -1.49
NISCH-201ENST00000345716 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-201ENST00000345716 KMT2DO14686 5537 aa5.6□□□□□ -1.51
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-201ENST00000345716 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
NISCH-201ENST00000345716 LCE4AQ5TA78 99 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-201ENST00000345716 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
NISCH-201ENST00000345716 SSPOA2VEC9 5147 aa5.28□□□□□ -1.56
NISCH-201ENST00000345716 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.23□□□□□ -1.57
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-9P26371 169 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-201ENST00000345716 NEBP20929 6669 aa4.91□□□□□ -1.62
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.86□□□□□ -1.63
NISCH-201ENST00000345716 MDN1Q9NU22 5596 aa4.79□□□□□ -1.64
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.76□□□□□ -1.65
NISCH-201ENST00000345716 LCE1CQ5T751 118 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-201ENST00000345716 LCE1EQ5T753 118 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-201ENST00000345716 LCE1FQ5T754 118 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.53□□□□□ -1.68
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
NISCH-201ENST00000345716 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.48□□□□□ -1.69
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.46□□□□□ -1.69
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.41□□□□□ -1.7
NISCH-201ENST00000345716 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.16□□□□□ -1.74
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.15□□□□□ -1.75
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.09□□□□□ -1.75
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.09□□□□□ -1.75
NISCH-201ENST00000345716 MUC5ACP98088 5654 aa4.03□□□□□ -1.76
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.85□□□□□ -1.79
NISCH-201ENST00000345716 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.83□□□□□ -1.8
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.7□□□□□ -1.82
NISCH-201ENST00000345716 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.63□□□□□ -1.83
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-8O75690 187 aa3.57□□□□□ -1.84
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.57□□□□□ -1.84
NISCH-201ENST00000345716 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.24□□□□□ -1.89
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.18□□□□□ -1.9
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.12□□□□□ -1.91
NISCH-201ENST00000345716 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
NISCH-201ENST00000345716 PHGR1C9JFL3 82 aa2.91□□□□□ -1.94
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.72□□□□□ -1.97
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.64□□□□□ -1.99
NISCH-201ENST00000345716 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.85□□□□□ -2.11
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