RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 MT1LQ93083 61 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXA3-201ENST00000317201 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
HOXA3-201ENST00000317201 LCE4AQ5TA78 99 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-9P26371 169 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.97□□□□□ -1.61
HOXA3-201ENST00000317201 MT1GP13640 62 aa4.96□□□□□ -1.62
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP12-4P60329 112 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 MT1MQ8N339 61 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.83□□□□□ -1.64
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXA3-201ENST00000317201 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2EP22531 72 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2BP35325 72 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2AP35326 72 aa4.71□□□□□ -1.66
HOXA3-201ENST00000317201 MDN1Q9NU22 5596 aa4.69□□□□□ -1.66
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2DP22532 72 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXA3-201ENST00000317201 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
HOXA3-201ENST00000317201 PRM1P04553 51 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.45□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 NEBP20929 6669 aa4.45□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1EQ5T753 118 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1FQ5T754 118 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXA3-201ENST00000317201 LCE3BQ5TA77 95 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXA3-201ENST00000317201 MT1AP04731 61 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXA3-201ENST00000317201 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.35□□□□□ -1.71
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.27□□□□□ -1.73
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1DQ5T752 114 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXA3-201ENST00000317201 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.12□□□□□ -1.75
HOXA3-201ENST00000317201 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.01□□□□□ -1.77
HOXA3-201ENST00000317201 MT3P25713 68 aa3.94□□□□□ -1.78
HOXA3-201ENST00000317201 MT4P47944 62 aa3.9□□□□□ -1.79
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.88□□□□□ -1.79
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.82□□□□□ -1.8
HOXA3-201ENST00000317201 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.8□□□□□ -1.8
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.75□□□□□ -1.81
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.75□□□□□ -1.81
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.72□□□□□ -1.81
HOXA3-201ENST00000317201 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.59□□□□□ -1.83
HOXA3-201ENST00000317201 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.26□□□□□ -1.89
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.25□□□□□ -1.89
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-8O75690 187 aa3.21□□□□□ -1.9
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1CQ5T751 118 aa3.2□□□□□ -1.9
HOXA3-201ENST00000317201 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.2□□□□□ -1.9
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.19□□□□□ -1.9
HOXA3-201ENST00000317201 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.18□□□□□ -1.9
HOXA3-201ENST00000317201 MUC5ACP98088 5654 aa3.15□□□□□ -1.91
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.82□□□□□ -1.96
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.81□□□□□ -1.96
HOXA3-201ENST00000317201 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.74□□□□□ -1.97
HOXA3-201ENST00000317201 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.49□□□□□ -2.01
HOXA3-201ENST00000317201 PHGR1C9JFL3 82 aa2.4□□□□□ -2.02
HOXA3-201ENST00000317201 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.58□□□□□ -2.16
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