RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.58□□□□□ -1.36
MVB12A-201ENST00000317040 KMT2DO14686 5537 aa6.54□□□□□ -1.36
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.52□□□□□ -1.37
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.5□□□□□ -1.37
MVB12A-201ENST00000317040 MT1LQ93083 61 aa6.45□□□□□ -1.38
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.44□□□□□ -1.38
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.41□□□□□ -1.38
MVB12A-201ENST00000317040 MT1EP04732 61 aa6.37□□□□□ -1.39
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-9P26371 169 aa6.31□□□□□ -1.4
MVB12A-201ENST00000317040 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.26□□□□□ -1.41
MVB12A-201ENST00000317040 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.25□□□□□ -1.41
MVB12A-201ENST00000317040 MDN1Q9NU22 5596 aa6.18□□□□□ -1.42
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP12-4P60329 112 aa6.11□□□□□ -1.43
MVB12A-201ENST00000317040 NEBP20929 6669 aa6.07□□□□□ -1.44
MVB12A-201ENST00000317040 SPRR2EP22531 72 aa6.03□□□□□ -1.44
MVB12A-201ENST00000317040 SPRR2BP35325 72 aa6.03□□□□□ -1.44
MVB12A-201ENST00000317040 SPRR2AP35326 72 aa6.03□□□□□ -1.44
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.03□□□□□ -1.44
MVB12A-201ENST00000317040 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.98□□□□□ -1.45
MVB12A-201ENST00000317040 MT1GP13640 62 aa5.95□□□□□ -1.46
MVB12A-201ENST00000317040 MT1MQ8N339 61 aa5.92□□□□□ -1.46
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.89□□□□□ -1.47
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.87□□□□□ -1.47
MVB12A-201ENST00000317040 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.84□□□□□ -1.47
MVB12A-201ENST00000317040 SPRR2DP22532 72 aa5.82□□□□□ -1.48
MVB12A-201ENST00000317040 MT1AP04731 61 aa5.8□□□□□ -1.48
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.72□□□□□ -1.49
MVB12A-201ENST00000317040 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
MVB12A-201ENST00000317040 LCE3BQ5TA77 95 aa5.63□□□□□ -1.51
MVB12A-201ENST00000317040 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.56□□□□□ -1.52
MVB12A-201ENST00000317040 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.56□□□□□ -1.52
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.55□□□□□ -1.52
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.51□□□□□ -1.53
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
MVB12A-201ENST00000317040 PRM1P04553 51 aa5.46□□□□□ -1.54
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.42□□□□□ -1.54
MVB12A-201ENST00000317040 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.17□□□□□ -1.58
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.16□□□□□ -1.58
MVB12A-201ENST00000317040 LCE4AQ5TA78 99 aa5.15□□□□□ -1.58
MVB12A-201ENST00000317040 MT4P47944 62 aa5.08□□□□□ -1.6
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1DQ5T752 114 aa5.07□□□□□ -1.6
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.07□□□□□ -1.6
MVB12A-201ENST00000317040 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.02□□□□□ -1.61
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.01□□□□□ -1.61
MVB12A-201ENST00000317040 MT3P25713 68 aa4.87□□□□□ -1.63
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.85□□□□□ -1.63
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.7□□□□□ -1.66
MVB12A-201ENST00000317040 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.62□□□□□ -1.67
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.6□□□□□ -1.67
MVB12A-201ENST00000317040 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.53□□□□□ -1.68
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.48□□□□□ -1.69
MVB12A-201ENST00000317040 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.47□□□□□ -1.69
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1EQ5T753 118 aa4.41□□□□□ -1.7
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.33□□□□□ -1.72
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.22□□□□□ -1.73
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-8O75690 187 aa4.17□□□□□ -1.74
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.06□□□□□ -1.76
MVB12A-201ENST00000317040 MUC5ACP98088 5654 aa4.01□□□□□ -1.77
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1FQ5T754 118 aa3.93□□□□□ -1.78
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.85□□□□□ -1.79
MVB12A-201ENST00000317040 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.79□□□□□ -1.8
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.78□□□□□ -1.8
MVB12A-201ENST00000317040 LCE1CQ5T751 118 aa3.75□□□□□ -1.81
MVB12A-201ENST00000317040 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.59□□□□□ -1.83
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.52□□□□□ -1.85
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.35□□□□□ -1.87
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.29□□□□□ -1.88
MVB12A-201ENST00000317040 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.04□□□□□ -1.92
MVB12A-201ENST00000317040 PHGR1C9JFL3 82 aa2.89□□□□□ -1.95
MVB12A-201ENST00000317040 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.88□□□□□ -1.95
MVB12A-201ENST00000317040 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.88□□□□□ -2.11
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