RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301272.6

TMIGD2-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD2, Length 1,262 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2-201ENST00000301272 MT1MQ8N339 61 aa6.74□□□□□ -1.33
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.74□□□□□ -1.33
TMIGD2-201ENST00000301272 PSPHP1O15172 72 aa6.71□□□□□ -1.34
TMIGD2-201ENST00000301272 V9GYY9 64 aa6.67□□□□□ -1.34
TMIGD2-201ENST00000301272 PP632Q6XCG6 107 aa6.63□□□□□ -1.35
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP12-3P60328 96 aa6.58□□□□□ -1.36
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.55□□□□□ -1.36
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE1DQ5T752 114 aa6.51□□□□□ -1.37
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.51□□□□□ -1.37
TMIGD2-201ENST00000301272 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TMIGD2-201ENST00000301272 K7ERS5 55 aa6.45□□□□□ -1.38
TMIGD2-201ENST00000301272 A6NED7 52 aa6.42□□□□□ -1.38
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.41□□□□□ -1.38
TMIGD2-201ENST00000301272 MT4P47944 62 aa6.39□□□□□ -1.39
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE4AQ5TA78 99 aa6.37□□□□□ -1.39
TMIGD2-201ENST00000301272 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.36□□□□□ -1.39
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.34□□□□□ -1.39
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.26□□□□□ -1.41
TMIGD2-201ENST00000301272 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.26□□□□□ -1.41
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TMIGD2-201ENST00000301272 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.21□□□□□ -1.42
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.19□□□□□ -1.42
TMIGD2-201ENST00000301272 ROMO1P60602 79 aa6.18□□□□□ -1.42
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.17□□□□□ -1.42
TMIGD2-201ENST00000301272 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.15□□□□□ -1.42
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.09□□□□□ -1.43
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.08□□□□□ -1.44
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.02□□□□□ -1.45
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.99□□□□□ -1.45
TMIGD2-201ENST00000301272 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TMIGD2-201ENST00000301272 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.94□□□□□ -1.46
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.89□□□□□ -1.47
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP12-4P60329 112 aa5.85□□□□□ -1.47
TMIGD2-201ENST00000301272 MT1AP04731 61 aa5.77□□□□□ -1.49
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.77□□□□□ -1.49
TMIGD2-201ENST00000301272 BRK1Q8WUW1 75 aa5.71□□□□□ -1.5
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.66□□□□□ -1.5
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.55□□□□□ -1.52
TMIGD2-201ENST00000301272 PRO0628Q9UI54 55 aa5.53□□□□□ -1.52
TMIGD2-201ENST00000301272 SVIPQ8NHG7 77 aa5.46□□□□□ -1.54
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.45□□□□□ -1.54
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.44□□□□□ -1.54
TMIGD2-201ENST00000301272 PMAIP1Q13794 54 aa5.4□□□□□ -1.54
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-8O75690 187 aa5.28□□□□□ -1.56
TMIGD2-201ENST00000301272 MUC5ACP98088 5654 aa5.25□□□□□ -1.57
TMIGD2-201ENST00000301272 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
TMIGD2-201ENST00000301272 MT3P25713 68 aa5.21□□□□□ -1.58
TMIGD2-201ENST00000301272 PRAC1Q96KF2 57 aa5.19□□□□□ -1.58
TMIGD2-201ENST00000301272 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMIGD2-201ENST00000301272 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.14□□□□□ -1.59
TMIGD2-201ENST00000301272 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.09□□□□□ -1.59
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.09□□□□□ -1.59
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.04□□□□□ -1.6
TMIGD2-201ENST00000301272 H3BS24 57 aa4.83□□□□□ -1.64
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE1EQ5T753 118 aa4.8□□□□□ -1.64
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.6□□□□□ -1.67
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE1CQ5T751 118 aa4.47□□□□□ -1.69
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.47□□□□□ -1.69
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.37□□□□□ -1.71
TMIGD2-201ENST00000301272 LUZP6Q538Z0 58 aa4.21□□□□□ -1.74
TMIGD2-201ENST00000301272 A0A0A0MQY5 61 aa4.14□□□□□ -1.75
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.13□□□□□ -1.75
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.09□□□□□ -1.75
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.06□□□□□ -1.76
TMIGD2-201ENST00000301272 NDUFAF8A1L188 74 aa3.94□□□□□ -1.78
TMIGD2-201ENST00000301272 LCE1FQ5T754 118 aa3.86□□□□□ -1.79
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.83□□□□□ -1.8
TMIGD2-201ENST00000301272 PHGR1C9JFL3 82 aa3.68□□□□□ -1.82
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.43□□□□□ -1.86
TMIGD2-201ENST00000301272 INE1O15225 51 aa3.39□□□□□ -1.87
TMIGD2-201ENST00000301272 PRM1P04553 51 aa3.2□□□□□ -1.9
TMIGD2-201ENST00000301272 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.17□□□□□ -1.9
TMIGD2-201ENST00000301272 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.78□□□□□ -1.96
TMIGD2-201ENST00000301272 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms