RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
AFG3L2-201ENST00000269143 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.5□□□□□ -1.53
AFG3L2-201ENST00000269143 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.46□□□□□ -1.54
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.44□□□□□ -1.54
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP12-4P60329 112 aa5.44□□□□□ -1.54
AFG3L2-201ENST00000269143 MT1LQ93083 61 aa5.43□□□□□ -1.54
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.37□□□□□ -1.55
AFG3L2-201ENST00000269143 MT1EP04732 61 aa5.34□□□□□ -1.55
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.34□□□□□ -1.55
AFG3L2-201ENST00000269143 MT1GP13640 62 aa5.33□□□□□ -1.56
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.33□□□□□ -1.56
AFG3L2-201ENST00000269143 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
AFG3L2-201ENST00000269143 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.2□□□□□ -1.58
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.12□□□□□ -1.59
AFG3L2-201ENST00000269143 MDN1Q9NU22 5596 aa5.1□□□□□ -1.59
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE3BQ5TA77 95 aa5.07□□□□□ -1.6
AFG3L2-201ENST00000269143 SPRR2FQ96RM1 72 aa5□□□□□ -1.61
AFG3L2-201ENST00000269143 MT1MQ8N339 61 aa5□□□□□ -1.61
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.94□□□□□ -1.62
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.92□□□□□ -1.62
AFG3L2-201ENST00000269143 PRM1P04553 51 aa4.89□□□□□ -1.63
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.8□□□□□ -1.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.8□□□□□ -1.64
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.75□□□□□ -1.65
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.7□□□□□ -1.66
AFG3L2-201ENST00000269143 MT1AP04731 61 aa4.68□□□□□ -1.66
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-9P26371 169 aa4.68□□□□□ -1.66
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
AFG3L2-201ENST00000269143 SPRR2EP22531 72 aa4.6□□□□□ -1.67
AFG3L2-201ENST00000269143 SPRR2BP35325 72 aa4.6□□□□□ -1.67
AFG3L2-201ENST00000269143 SPRR2AP35326 72 aa4.6□□□□□ -1.67
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.55□□□□□ -1.68
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.54□□□□□ -1.68
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.54□□□□□ -1.68
AFG3L2-201ENST00000269143 SPRR2DP22532 72 aa4.38□□□□□ -1.71
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.29□□□□□ -1.72
AFG3L2-201ENST00000269143 NEBP20929 6669 aa4.23□□□□□ -1.73
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.18□□□□□ -1.74
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.17□□□□□ -1.74
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1EQ5T753 118 aa4.14□□□□□ -1.75
AFG3L2-201ENST00000269143 MT4P47944 62 aa4.05□□□□□ -1.76
AFG3L2-201ENST00000269143 MT3P25713 68 aa4.02□□□□□ -1.77
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.99□□□□□ -1.77
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1DQ5T752 114 aa3.97□□□□□ -1.77
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.94□□□□□ -1.78
AFG3L2-201ENST00000269143 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.91□□□□□ -1.78
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE4AQ5TA78 99 aa3.82□□□□□ -1.8
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.7□□□□□ -1.82
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.67□□□□□ -1.82
AFG3L2-201ENST00000269143 MUC5ACP98088 5654 aa3.66□□□□□ -1.82
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.65□□□□□ -1.83
AFG3L2-201ENST00000269143 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.64□□□□□ -1.83
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.61□□□□□ -1.83
AFG3L2-201ENST00000269143 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.59□□□□□ -1.84
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.55□□□□□ -1.84
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.38□□□□□ -1.87
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.36□□□□□ -1.87
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.32□□□□□ -1.88
AFG3L2-201ENST00000269143 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.21□□□□□ -1.9
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1FQ5T754 118 aa3.21□□□□□ -1.9
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.17□□□□□ -1.9
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.14□□□□□ -1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.13□□□□□ -1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.12□□□□□ -1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 LCE1CQ5T751 118 aa3.1□□□□□ -1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-8O75690 187 aa3.05□□□□□ -1.92
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.97□□□□□ -1.93
AFG3L2-201ENST00000269143 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
AFG3L2-201ENST00000269143 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.65□□□□□ -1.98
AFG3L2-201ENST00000269143 PHGR1C9JFL3 82 aa2.31□□□□□ -2.04
AFG3L2-201ENST00000269143 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms